224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0756 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  69.54 
 
 		 2192 aa  714    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 2042 aa  3868    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  71.81 
 
 		 3699 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  71.62 
 
 		 2503 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  68.07 
 
 		 3544 aa  623  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  70.86 
 
 		 3699 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  69.7 
 
 		 2522 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  63.95 
 
 		 1804 aa  538  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  70.32 
 
 		 2476 aa  525  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  54.06 
 
 		 1879 aa  332  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  70.63 
 
 		 1911 aa  313  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  56.54 
 
 		 777 aa  279  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  40.61 
 
 		 1902 aa  250  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  52.57 
 
 		 916 aa  244  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  50.38 
 
 		 1951 aa  244  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  47.92 
 
 		 2528 aa  228  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  50.38 
 
 		 549 aa  227  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  36.18 
 
 		 1585 aa  227  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  34.56 
 
 		 1588 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  35.34 
 
 		 898 aa  177  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  55.79 
 
 		 1394 aa  171  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  36.81 
 
 		 913 aa  170  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  56.83 
 
 		 859 aa  159  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  42.92 
 
 		 2042 aa  158  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  33.99 
 
 		 899 aa  155  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  59.79 
 
 		 1695 aa  152  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  34.55 
 
 		 937 aa  142  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 888 aa  141  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  54.84 
 
 		 3089 aa  127  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  36.62 
 
 		 906 aa  121  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.98 
 
 		 757 aa  120  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  51.23 
 
 		 336 aa  119  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  63.81 
 
 		 1241 aa  119  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  35.34 
 
 		 694 aa  115  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  33.62 
 
 		 759 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  28.52 
 
 		 9585 aa  111  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  52.89 
 
 		 2207 aa  111  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  58.09 
 
 		 1673 aa  109  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  51.2 
 
 		 3227 aa  108  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  49.6 
 
 		 3477 aa  108  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  37.97 
 
 		 767 aa  106  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  34.96 
 
 		 1672 aa  105  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  69.41 
 
 		 1310 aa  104  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  33.85 
 
 		 3925 aa  101  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  57.85 
 
 		 1848 aa  100  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  31.94 
 
 		 1047 aa  98.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  33.56 
 
 		 545 aa  97.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2564  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  47.51 
 
 		 247 aa  96.3  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  54.01 
 
 		 2636 aa  94.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  32.01 
 
 		 696 aa  94.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  34.63 
 
 		 482 aa  94.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  41.45 
 
 		 3066 aa  94  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  31.41 
 
 		 659 aa  91.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  40.82 
 
 		 3089 aa  91.3  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  36.32 
 
 		 3586 aa  90.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  58.62 
 
 		 475 aa  89.4  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  33.33 
 
 		 1550 aa  89.4  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  40.52 
 
 		 14944 aa  88.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  43.62 
 
 		 1779 aa  87.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  31.53 
 
 		 2039 aa  87.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  35.47 
 
 		 6109 aa  87  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  33.69 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  30.86 
 
 		 593 aa  86.7  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.95 
 
 		 1197 aa  86.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.62 
 
 		 1628 aa  86.3  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  32.98 
 
 		 665 aa  86.3  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  39.73 
 
 		 717 aa  85.5  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  39.89 
 
 		 1538 aa  85.5  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  30 
 
 		 546 aa  84.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  68.6 
 
 		 1035 aa  84  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  40.23 
 
 		 1439 aa  83.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  30.56 
 
 		 2056 aa  82  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  40.36 
 
 		 2160 aa  81.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  36.14 
 
 		 2117 aa  80.9  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27.31 
 
 		 2350 aa  80.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  42.54 
 
 		 1532 aa  78.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  29.06 
 
 		 1332 aa  79  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  48.84 
 
 		 556 aa  79  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.06 
 
 		 12684 aa  78.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  32.98 
 
 		 2067 aa  77.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  31.93 
 
 		 2047 aa  77.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1010 aa  77.4  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  28.69 
 
 		 2084 aa  76.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.78 
 
 		 852 aa  76.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  47.22 
 
 		 983 aa  76.3  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  43.41 
 
 		 2927 aa  76.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  29.1 
 
 		 2011 aa  75.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  28.47 
 
 		 601 aa  75.5  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  32.4 
 
 		 527 aa  74.7  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  28.73 
 
 		 1037 aa  73.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  34.81 
 
 		 2052 aa  73.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  34.27 
 
 		 3911 aa  73.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  66.67 
 
 		 2802 aa  73.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  38.69 
 
 		 786 aa  73.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  32.3 
 
 		 591 aa  72.4  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  37.11 
 
 		 1869 aa  72.4  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  48.31 
 
 		 2043 aa  72  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  44.83 
 
 		 2051 aa  72  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  33.45 
 
 		 1461 aa  72  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  34.12 
 
 		 606 aa  71.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>