32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2855 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 726 aa  1373    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  69.92 
 
 		 740 aa  948    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1017  cell surface receptor IPT/TIG  46.02 
 
 		 378 aa  124  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0346067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1229  hypothetical protein  27.23 
 
 		 857 aa  100  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.627045  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1932  hypothetical protein  26.96 
 
 		 604 aa  85.5  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  40.64 
 
 		 1394 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.69 
 
 		 859 aa  74.7  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  33.02 
 
 		 1695 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0325  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.73 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1018  hypothetical protein  37.04 
 
 		 647 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0666768  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0432  hypothetical protein  29.09 
 
 		 1002 aa  60.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.259517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2563  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.6 
 
 		 336 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  39.47 
 
 		 2042 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  30.3 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3471  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.57 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1256  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1742 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.706076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0332  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1066 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.635539  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1357  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1743 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0819282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  35.76 
 
 		 14944 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3409  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.49 
 
 		 297 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1289 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  36.72 
 
 		 1134 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2592  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1743 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1247  cell surface receptor IPT/TIG  30.48 
 
 		 316 aa  53.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1684  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  25.52 
 
 		 363 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00411006  hitchhiker  0.00000638895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  35 
 
 		 1140 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2088  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.97 
 
 		 323 aa  50.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  41.84 
 
 		 1310 aa  48.5  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1640  IPT/TIG domain-containing protein  23.58 
 
 		 303 aa  48.5  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000419405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  39.1 
 
 		 1245 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1924  IPT/TIG domain-containing protein  29.03 
 
 		 312 aa  48.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.859197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  35 
 
 		 665 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>