22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0332 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0332  hypothetical protein  100 
 
 
1066 aa  2088    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.635539  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1018  hypothetical protein  29.16 
 
 
647 aa  101  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0666768  normal  0.893035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1017  cell surface receptor IPT/TIG  35.86 
 
 
378 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0346067  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  32.57 
 
 
1140 aa  84.7  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  37.8 
 
 
587 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  32.27 
 
 
1134 aa  75.1  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.69 
 
 
740 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  32.77 
 
 
1293 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  40.5 
 
 
726 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  41.23 
 
 
826 aa  62.4  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  37.29 
 
 
1989 aa  62  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.64 
 
 
3191 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  37.08 
 
 
1150 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  35.96 
 
 
1168 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  35.85 
 
 
907 aa  51.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  33.94 
 
 
2573 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  35.65 
 
 
3324 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  38.46 
 
 
451 aa  50.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  35.5 
 
 
3921 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  35.12 
 
 
983 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  35.48 
 
 
726 aa  45.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2931  WD40 domain protein beta Propeller  31.85 
 
 
1029 aa  44.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>