43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4056 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  100 
 
 
1134 aa  2225    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  52.63 
 
 
1140 aa  1105    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  33.07 
 
 
740 aa  240  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  33.72 
 
 
841 aa  222  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  40.2 
 
 
363 aa  124  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2601  hypothetical protein  24.22 
 
 
704 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000676276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  23.3 
 
 
797 aa  103  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  27.2 
 
 
1061 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  27.57 
 
 
446 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3181  hypothetical protein  31.5 
 
 
687 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4234  hypothetical protein  27.64 
 
 
716 aa  69.7  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  27.44 
 
 
460 aa  68.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3824  hypothetical protein  25 
 
 
726 aa  67.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.510661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1250  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  42.06 
 
 
740 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816915  normal  0.345768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  23.25 
 
 
1280 aa  66.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  31.16 
 
 
726 aa  62  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3856  hypothetical protein  34.65 
 
 
723 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000936038  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  25.13 
 
 
888 aa  59.3  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2290  hypothetical protein  26.92 
 
 
726 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  32.44 
 
 
1916 aa  58.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  25.91 
 
 
587 aa  58.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  23.24 
 
 
3563 aa  58.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  28.71 
 
 
857 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.72 
 
 
726 aa  55.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  28.52 
 
 
597 aa  55.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  27.98 
 
 
381 aa  54.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  27.78 
 
 
1991 aa  52.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  31.53 
 
 
1989 aa  53.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03520  bud site selection-related protein, putative  28.71 
 
 
1376 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0332  hypothetical protein  31.36 
 
 
1066 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.635539  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  28.42 
 
 
645 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  31.63 
 
 
1293 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  32.77 
 
 
826 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  31.85 
 
 
734 aa  48.9  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 
1168 aa  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  33.09 
 
 
425 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  33.33 
 
 
943 aa  47  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1017  cell surface receptor IPT/TIG  38.95 
 
 
378 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0346067  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  31.4 
 
 
3921 aa  46.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  31.82 
 
 
1565 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1899  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  45.8  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  29.41 
 
 
1537 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  29.41 
 
 
3634 aa  45.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>