30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2051 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  932    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  34.69 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  33.11 
 
 		 841 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  30.61 
 
 		 740 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1140 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  28.71 
 
 		 363 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2523  hypothetical protein  23.41 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  26.26 
 
 		 645 aa  70.1  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1134 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1061 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3181  hypothetical protein  25.45 
 
 		 687 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2601  hypothetical protein  25.81 
 
 		 704 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000676276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  25.74 
 
 		 888 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  25.89 
 
 		 797 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  24.19 
 
 		 378 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7624  hypothetical protein  21.43 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.130865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  26.18 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  31.65 
 
 		 447 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1427  hypothetical protein  25.81 
 
 		 303 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.88 
 
 		 597 aa  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1165  hypothetical protein  27.46 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03520  bud site selection-related protein, putative  25.82 
 
 		 1376 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  23.94 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3824  hypothetical protein  24.19 
 
 		 726 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.510661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  25.2 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  25.08 
 
 		 930 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  26.34 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  34.48 
 
 		 1132 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  29.38 
 
 		 2831 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  23.9 
 
 		 608 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>