26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0459 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  59.46 
 
 
841 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  55.42 
 
 
740 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  40.2 
 
 
1134 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  39.27 
 
 
1140 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  29.38 
 
 
1061 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  32.81 
 
 
797 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1899  hypothetical protein  53.41 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2601  hypothetical protein  29.03 
 
 
704 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000676276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  32.14 
 
 
446 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  28.71 
 
 
460 aa  73.2  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3824  hypothetical protein  38.58 
 
 
726 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.510661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  30.5 
 
 
1565 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3181  hypothetical protein  27.11 
 
 
687 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.67 
 
 
597 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3856  hypothetical protein  28.81 
 
 
723 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000936038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4234  hypothetical protein  40.98 
 
 
716 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  32.8 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1165  hypothetical protein  29.14 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2290  hypothetical protein  27.27 
 
 
726 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  31.05 
 
 
888 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  26.38 
 
 
645 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  23.83 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.08 
 
 
1916 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  37.72 
 
 
1991 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06685  cellular morphogenesis protein (Rax2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05340)  32.61 
 
 
1214 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>