51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2600 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  59.14 
 
 
1061 aa  917    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  100 
 
 
797 aa  1617    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2601  hypothetical protein  40.17 
 
 
704 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000676276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  27.26 
 
 
740 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  24.36 
 
 
841 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  23.82 
 
 
1134 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  24.09 
 
 
1140 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4234  hypothetical protein  24.33 
 
 
716 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  32.81 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  32.97 
 
 
446 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3181  hypothetical protein  21.1 
 
 
687 aa  64.7  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2290  hypothetical protein  23.21 
 
 
726 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  26.37 
 
 
460 aa  62.4  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3824  hypothetical protein  20.82 
 
 
726 aa  61.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.510661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  36.36 
 
 
3477 aa  58.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  38.37 
 
 
892 aa  56.6  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  35.21 
 
 
1363 aa  55.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  29.41 
 
 
1367 aa  55.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  46.48 
 
 
721 aa  54.7  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3856  hypothetical protein  30 
 
 
723 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000936038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  32.71 
 
 
3474 aa  51.6  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  37.93 
 
 
814 aa  51.2  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  37.23 
 
 
4748 aa  51.2  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  39.02 
 
 
2040 aa  50.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  37.93 
 
 
1394 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.79 
 
 
2346 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  34.34 
 
 
4978 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.38 
 
 
994 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 
761 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.77 
 
 
3363 aa  49.3  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  45 
 
 
850 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 
1287 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  35.21 
 
 
1126 aa  48.9  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  35.35 
 
 
4848 aa  48.9  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 
982 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  38.89 
 
 
2816 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  35.82 
 
 
722 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.84 
 
 
4220 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  24.49 
 
 
9867 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.84 
 
 
1597 aa  46.6  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48 
 
 
1673 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  37 
 
 
1222 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  29.03 
 
 
560 aa  45.8  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.84 
 
 
846 aa  46.2  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  33.33 
 
 
570 aa  45.8  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  30.08 
 
 
381 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.77 
 
 
3089 aa  44.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  41.89 
 
 
1269 aa  44.3  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  32.97 
 
 
4854 aa  44.3  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.63 
 
 
2377 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  34.69 
 
 
2145 aa  44.3  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>