34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2802 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1596    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  53.17 
 
 		 740 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  57.09 
 
 		 363 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  33.48 
 
 		 1134 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1140 aa  217  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  25 
 
 		 1061 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.66 
 
 		 597 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  24.36 
 
 		 797 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  32.65 
 
 		 460 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  30.05 
 
 		 446 aa  101  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3824  hypothetical protein  22.73 
 
 		 726 aa  95.1  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.510661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1899  hypothetical protein  56.18 
 
 		 89 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2601  hypothetical protein  24.19 
 
 		 704 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000676276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3181  hypothetical protein  24.12 
 
 		 687 aa  85.9  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  25.9 
 
 		 888 aa  84.7  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4234  hypothetical protein  23.52 
 
 		 716 aa  74.7  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2290  hypothetical protein  21.35 
 
 		 726 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1280 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3856  hypothetical protein  22.43 
 
 		 723 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000936038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2523  hypothetical protein  24.46 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  25.2 
 
 		 3322 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  29.58 
 
 		 381 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  24.17 
 
 		 378 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  29.96 
 
 		 1565 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1588 aa  48.5  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  30.3 
 
 		 1916 aa  48.5  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  26.42 
 
 		 734 aa  47.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03520  bud site selection-related protein, putative  33.33 
 
 		 1376 aa  47.8  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  25.63 
 
 		 943 aa  47  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1585 aa  46.2  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1165  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  45.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  29.05 
 
 		 645 aa  45.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  24.93 
 
 		 770 aa  44.7  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0581  hypothetical protein  34.54 
 
 		 403 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>