14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1165 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1165  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  765    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2523  hypothetical protein  29.2 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  22.64 
 
 
888 aa  70.1  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1087  hypothetical protein  24.76 
 
 
375 aa  53.5  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.344662  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3134  hypothetical protein  27.48 
 
 
511 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00000464771  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  27.46 
 
 
460 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  29.14 
 
 
363 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0150  hypothetical protein  25.99 
 
 
831 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  29.45 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  30.68 
 
 
757 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  28.57 
 
 
841 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  30.7 
 
 
740 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  28.37 
 
 
1672 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  19.4 
 
 
1140 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>