73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1108 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  944    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  82.93 
 
 		 456 aa  716    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  61.21 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  45.93 
 
 		 439 aa  313  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  43.42 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  44.53 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  38.39 
 
 		 480 aa  223  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  39.95 
 
 		 513 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  30.96 
 
 		 450 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  35.93 
 
 		 3507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  35.64 
 
 		 2068 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  32.94 
 
 		 4433 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.92 
 
 		 1272 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  27.14 
 
 		 472 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  30 
 
 		 430 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  27.49 
 
 		 400 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  27.19 
 
 		 940 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  29.81 
 
 		 2286 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  27.82 
 
 		 401 aa  87.4  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  27.13 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  26.68 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  26.53 
 
 		 938 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.46 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  26.7 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  32.65 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  23.13 
 
 		 696 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  26.72 
 
 		 688 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.93 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  25.86 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  26.21 
 
 		 676 aa  66.6  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.06 
 
 		 930 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28.82 
 
 		 579 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.76 
 
 		 1848 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  23.23 
 
 		 2807 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.97 
 
 		 627 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.08 
 
 		 930 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  29.09 
 
 		 917 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  28.69 
 
 		 831 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  26.51 
 
 		 840 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  28.99 
 
 		 668 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  24.86 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  26.7 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.9 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  21.87 
 
 		 1329 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  25.08 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  26.61 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  27.85 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  25.74 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  29.29 
 
 		 664 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  24.5 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  25 
 
 		 1969 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.31 
 
 		 752 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  24.92 
 
 		 709 aa  54.3  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  29.33 
 
 		 447 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  22.54 
 
 		 391 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.84 
 
 		 307 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  23.81 
 
 		 761 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  25.2 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  29.53 
 
 		 258 aa  52.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  27.5 
 
 		 812 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  26.18 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  24.65 
 
 		 870 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  23.44 
 
 		 429 aa  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  24.6 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  28.09 
 
 		 588 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1933 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1976 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  25.11 
 
 		 343 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  24.16 
 
 		 603 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  29.21 
 
 		 629 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  23.38 
 
 		 481 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.7 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  24.57 
 
 		 2554 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>