17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7624 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7624  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  792    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.130865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1310  hypothetical protein  34.53 
 
 
382 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186399  normal  0.248493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2703  hypothetical protein  32.12 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0453731  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4634  hypothetical protein  27.49 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0937  hypothetical protein  28.53 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4694  hypothetical protein  28.49 
 
 
351 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1944  hypothetical protein  26.4 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0693  hypothetical protein  28.12 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4930  hypothetical protein  30.16 
 
 
396 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1207  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.09 
 
 
616 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  28.91 
 
 
378 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  21.27 
 
 
460 aa  53.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2091  hypothetical protein  28.91 
 
 
376 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133003  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  26.74 
 
 
1024 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.1 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  24.8 
 
 
740 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  28.28 
 
 
794 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>