81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0329 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  100 
 
 		 439 aa  873    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  45.93 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  45.16 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  46.81 
 
 		 463 aa  312  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  46.73 
 
 		 485 aa  289  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  39.86 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  37.7 
 
 		 480 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  34.98 
 
 		 513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  31.81 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  32.96 
 
 		 3507 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.53 
 
 		 1272 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  30.43 
 
 		 2068 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  29.67 
 
 		 472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  29.77 
 
 		 4433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  28.39 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  35.2 
 
 		 460 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  28.98 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  28.64 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  29.18 
 
 		 491 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  27.96 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  29.02 
 
 		 2286 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  29.29 
 
 		 940 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  27.08 
 
 		 938 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  27.49 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  28.37 
 
 		 688 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  28.02 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.25 
 
 		 930 aa  71.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.53 
 
 		 676 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  35.06 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.75 
 
 		 668 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28.92 
 
 		 579 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.17 
 
 		 930 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.79 
 
 		 627 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  32.43 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  30.91 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  32.04 
 
 		 917 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.84 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  29.61 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  24.93 
 
 		 2554 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  23.42 
 
 		 2807 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  26.92 
 
 		 553 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1329 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  29.86 
 
 		 664 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  24.37 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  24.31 
 
 		 696 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  24.35 
 
 		 2198 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  28.91 
 
 		 831 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  27.01 
 
 		 801 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.48 
 
 		 1848 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  24.46 
 
 		 603 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.87 
 
 		 709 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  24.21 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  27.59 
 
 		 840 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  25.46 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  24.93 
 
 		 708 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  24.82 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  24.75 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1933 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.79 
 
 		 522 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.5 
 
 		 307 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  23.14 
 
 		 588 aa  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  22.59 
 
 		 3295 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  26.05 
 
 		 812 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.93 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.02 
 
 		 752 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  28.1 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  23.76 
 
 		 870 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  26.34 
 
 		 629 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1969 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  25.2 
 
 		 460 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  26.9 
 
 		 528 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  24.89 
 
 		 1531 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  22.86 
 
 		 761 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  23.58 
 
 		 1351 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  27.84 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  22.78 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  34.45 
 
 		 200 aa  44.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  35.37 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  30.6 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1750 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  25.95 
 
 		 1532 aa  43.1  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>