22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1858 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  100 
 
 		 888 aa  1794    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  25.42 
 
 		 1550 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  30.09 
 
 		 1804 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0437  hypothetical protein  28.52 
 
 		 585 aa  95.9  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.516029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2523  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  87.8  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0150  hypothetical protein  28.33 
 
 		 831 aa  77.8  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  34.88 
 
 		 978 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1165  hypothetical protein  22.64 
 
 		 390 aa  64.3  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  34.96 
 
 		 1266 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  34.33 
 
 		 627 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  25.74 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1518 aa  55.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0882  hypothetical protein  23.55 
 
 		 282 aa  53.5  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  30.14 
 
 		 1002 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  25.15 
 
 		 739 aa  50.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 		 3793 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1978  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase  32.95 
 
 		 797 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  24.87 
 
 		 695 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.39 
 
 		 1343 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  27.21 
 
 		 446 aa  45.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.75 
 
 		 2713 aa  45.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1087  hypothetical protein  23.67 
 
 		 375 aa  45.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.344662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>