100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3666 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  98.17 
 
 		 3634 aa  2585    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  100 
 
 		 1537 aa  3049    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1227 aa  259  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1202 aa  199  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  36.67 
 
 		 1293 aa  184  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  28.74 
 
 		 3471 aa  158  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1809 aa  152  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  29.91 
 
 		 2573 aa  144  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  27.22 
 
 		 3602 aa  134  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  27.9 
 
 		 3921 aa  126  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  28.6 
 
 		 744 aa  113  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  28.48 
 
 		 983 aa  99.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  26.72 
 
 		 1168 aa  92.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  27.34 
 
 		 1150 aa  92  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  28.42 
 
 		 1989 aa  91.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  25.96 
 
 		 4896 aa  88.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1332 aa  86.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  30.05 
 
 		 1118 aa  83.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  32.2 
 
 		 440 aa  80.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  26.53 
 
 		 1519 aa  78.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.81 
 
 		 3191 aa  77  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  27.88 
 
 		 2485 aa  72.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  41.46 
 
 		 5203 aa  68.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  27.69 
 
 		 2358 aa  67.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  27.69 
 
 		 2490 aa  67.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  27.69 
 
 		 2358 aa  67.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  35.71 
 
 		 587 aa  65.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  27.42 
 
 		 2490 aa  65.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  26.03 
 
 		 3209 aa  65.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  27.15 
 
 		 2490 aa  65.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  33.83 
 
 		 845 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  53.25 
 
 		 3373 aa  63.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  32.45 
 
 		 1263 aa  62.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  27.01 
 
 		 5010 aa  62.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  28.01 
 
 		 574 aa  62.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  26.56 
 
 		 2490 aa  62  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  42.52 
 
 		 5166 aa  62  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  22.69 
 
 		 3521 aa  61.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  26.84 
 
 		 5017 aa  60.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  26.84 
 
 		 5017 aa  60.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  26.89 
 
 		 5017 aa  60.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  28.12 
 
 		 2487 aa  60.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  26.58 
 
 		 5017 aa  59.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  28.57 
 
 		 2604 aa  59.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  25.69 
 
 		 2520 aa  59.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  22.78 
 
 		 3409 aa  59.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  27.39 
 
 		 2121 aa  58.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  23.38 
 
 		 3471 aa  58.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  29.67 
 
 		 775 aa  58.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  26.63 
 
 		 5017 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  23.5 
 
 		 3472 aa  58.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  34.13 
 
 		 612 aa  57.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  31.34 
 
 		 807 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  32.37 
 
 		 726 aa  57.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  27.53 
 
 		 5010 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  26.67 
 
 		 2912 aa  57.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  23.99 
 
 		 2025 aa  56.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  26.48 
 
 		 2520 aa  57  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0727  60 kDa outer membrane protein  26.32 
 
 		 554 aa  56.2  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00741455  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  26.6 
 
 		 5010 aa  56.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  28.71 
 
 		 2886 aa  55.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  27.22 
 
 		 5010 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1059 aa  55.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1038 aa  55.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  35.07 
 
 		 1898 aa  54.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  40 
 
 		 3324 aa  54.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  45.45 
 
 		 1243 aa  53.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  42.65 
 
 		 5517 aa  54.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1210  conserved repeat domain protein  29.08 
 
 		 617 aa  53.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  32.17 
 
 		 2047 aa  52.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1441 aa  51.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  30.67 
 
 		 826 aa  50.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  34.11 
 
 		 907 aa  50.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  26.29 
 
 		 743 aa  51.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1946 aa  51.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  26.72 
 
 		 1857 aa  50.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  33.86 
 
 		 4013 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  27.22 
 
 		 2490 aa  49.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  29.3 
 
 		 900 aa  49.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  27.38 
 
 		 2853 aa  48.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  26.11 
 
 		 924 aa  48.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  30.23 
 
 		 315 aa  48.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  28.04 
 
 		 2890 aa  48.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  40.91 
 
 		 2656 aa  48.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  28.66 
 
 		 2489 aa  48.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  27.37 
 
 		 2490 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2196  hypothetical protein  27.59 
 
 		 966 aa  47  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852049  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  40.22 
 
 		 801 aa  47  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  27.84 
 
 		 2113 aa  47  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  34.17 
 
 		 1750 aa  47  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  32.43 
 
 		 1337 aa  46.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  32.43 
 
 		 1337 aa  46.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  44.07 
 
 		 1153 aa  46.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  44.07 
 
 		 1153 aa  46.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  33.78 
 
 		 892 aa  45.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1134 aa  45.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  21.36 
 
 		 939 aa  45.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  25.45 
 
 		 2000 aa  45.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  38.98 
 
 		 965 aa  45.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  38.98 
 
 		 965 aa  45.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>