122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3403 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  98.17 
 
 		 1537 aa  2585    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  98.27 
 
 		 2078 aa  3752    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  34.45 
 
 		 3486 aa  753    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  38.71 
 
 		 8918 aa  746    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  100 
 
 		 3634 aa  7051    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  33.28 
 
 		 1989 aa  461  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  33.91 
 
 		 4896 aa  427  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  38.83 
 
 		 2912 aa  352  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  38.12 
 
 		 1946 aa  278  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  39.38 
 
 		 1441 aa  275  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  38.12 
 
 		 1898 aa  267  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1227 aa  254  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  40.06 
 
 		 1809 aa  241  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  38.3 
 
 		 2853 aa  211  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1202 aa  204  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  38.84 
 
 		 2886 aa  203  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  32.03 
 
 		 3920 aa  186  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  37.02 
 
 		 1293 aa  182  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  24.68 
 
 		 2487 aa  157  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  24.83 
 
 		 2490 aa  154  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  25.07 
 
 		 2490 aa  149  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  25.19 
 
 		 2490 aa  148  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  25.08 
 
 		 2358 aa  147  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  30.76 
 
 		 2573 aa  146  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  25.04 
 
 		 2358 aa  145  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  24.83 
 
 		 2490 aa  142  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  24.27 
 
 		 2490 aa  138  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  25.64 
 
 		 2485 aa  135  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  23.83 
 
 		 2520 aa  132  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  24.73 
 
 		 2489 aa  127  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  27.15 
 
 		 3602 aa  125  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  28.35 
 
 		 3471 aa  123  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  22.91 
 
 		 2520 aa  122  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  23.07 
 
 		 2121 aa  120  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1665 aa  120  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  25.18 
 
 		 2490 aa  116  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  28.93 
 
 		 3921 aa  115  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  27.96 
 
 		 744 aa  107  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  40.33 
 
 		 3191 aa  97.8  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  38.53 
 
 		 3771 aa  94.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  27 
 
 		 1168 aa  92.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  24.41 
 
 		 5010 aa  92.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  27.27 
 
 		 1150 aa  92  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  31.1 
 
 		 3360 aa  92  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  29.04 
 
 		 983 aa  91.3  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  36.32 
 
 		 801 aa  89.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  29.68 
 
 		 2604 aa  89  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  25.29 
 
 		 5010 aa  88.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  31.75 
 
 		 924 aa  87.8  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  24.47 
 
 		 5010 aa  87  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  32.17 
 
 		 3793 aa  86.7  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  23.87 
 
 		 1857 aa  85.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  43.28 
 
 		 2487 aa  84  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  23.01 
 
 		 5010 aa  81.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  32.58 
 
 		 440 aa  81.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 		 4897 aa  79.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  23.39 
 
 		 1533 aa  79  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  29.06 
 
 		 1118 aa  79.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  24.85 
 
 		 5017 aa  79  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  24.85 
 
 		 5017 aa  79  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  24.26 
 
 		 5017 aa  78.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1332 aa  78.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  23.9 
 
 		 5017 aa  77.8  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  23.12 
 
 		 2113 aa  77  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  38.21 
 
 		 1021 aa  76.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  26.65 
 
 		 1519 aa  75.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  24.26 
 
 		 5017 aa  73.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  38.36 
 
 		 3927 aa  70.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1580 aa  69.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  41.46 
 
 		 5203 aa  68.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  26.81 
 
 		 2434 aa  66.6  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  35.17 
 
 		 587 aa  65.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  26.35 
 
 		 2118 aa  65.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  26.97 
 
 		 509 aa  63.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  46.75 
 
 		 3373 aa  63.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  25.86 
 
 		 3209 aa  62  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  22.22 
 
 		 3521 aa  62.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 845 aa  61.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  32.45 
 
 		 1263 aa  61.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_205  hypothetical protein  31.96 
 
 		 653 aa  61.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  42.28 
 
 		 5166 aa  60.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1757 aa  60.8  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  23.38 
 
 		 3471 aa  60.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  23.8 
 
 		 3472 aa  59.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  22.84 
 
 		 3409 aa  59.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  27.4 
 
 		 574 aa  58.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  23.08 
 
 		 2025 aa  57.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  28.09 
 
 		 1015 aa  57.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0727  60 kDa outer membrane protein  27.18 
 
 		 554 aa  57  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00741455  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  28.99 
 
 		 2418 aa  56.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  34.62 
 
 		 612 aa  55.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  31.34 
 
 		 807 aa  56.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  29.77 
 
 		 775 aa  55.5  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  32.37 
 
 		 726 aa  54.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1210  conserved repeat domain protein  28.52 
 
 		 617 aa  54.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  26.87 
 
 		 978 aa  54.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  40 
 
 		 3324 aa  53.5  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  45.45 
 
 		 1243 aa  53.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  42.65 
 
 		 5517 aa  53.5  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20420  conserved repeat domain protein  25.38 
 
 		 1248 aa  53.5  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>