18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1210 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1210  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 617 aa  1248    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  26.06 
 
 		 951 aa  152  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0727  60 kDa outer membrane protein  27.04 
 
 		 554 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00741455  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.92 
 
 		 3191 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  23.89 
 
 		 3602 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  23.86 
 
 		 3921 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  27.78 
 
 		 1989 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  25.82 
 
 		 1533 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  27.66 
 
 		 3634 aa  47.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  25.41 
 
 		 743 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  23.96 
 
 		 2573 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1537 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  27.42 
 
 		 898 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  26.55 
 
 		 2520 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1624 aa  44.3  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1129  hypothetical protein  34.29 
 
 		 224 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  25.78 
 
 		 1118 aa  44.3  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  24.93 
 
 		 744 aa  44.3  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>