25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0727 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0727  60 kDa outer membrane protein  100 
 
 
554 aa  1133    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00741455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1210  conserved repeat domain protein  26.63 
 
 
617 aa  134  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  25.77 
 
 
951 aa  121  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  23.24 
 
 
1519 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  27.69 
 
 
3921 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  29.53 
 
 
1989 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  25.2 
 
 
3634 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  24.8 
 
 
1537 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  24.8 
 
 
1038 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  26.98 
 
 
440 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  25.16 
 
 
1168 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0581  conserved repeat domain protein  28.22 
 
 
880 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  22.78 
 
 
1624 aa  47.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  23.04 
 
 
2490 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  26.91 
 
 
2912 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  24.29 
 
 
2487 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  23.53 
 
 
2490 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2196  hypothetical protein  26.22 
 
 
966 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852049  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  23.53 
 
 
2358 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  23.53 
 
 
2358 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  24.58 
 
 
1118 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  27.14 
 
 
2573 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  25.25 
 
 
1150 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  23.04 
 
 
2490 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3278  hypothetical protein  30.34 
 
 
966 aa  43.9  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>