17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1129 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1129  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0364  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  46.48 
 
 
1989 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3093  conserved repeat domain protein  29.79 
 
 
313 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1146  hypothetical protein  32.67 
 
 
434 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000825613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  29.63 
 
 
1624 aa  45.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0059  hypothetical protein  31.3 
 
 
444 aa  45.1  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.291896  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1210  conserved repeat domain protein  34.29 
 
 
617 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.53 
 
 
3191 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  28.91 
 
 
1118 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  33.96 
 
 
2807 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  33.77 
 
 
2713 aa  42.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  34.07 
 
 
3911 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3450  hypothetical protein  46 
 
 
75 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0356  hypothetical protein  32.53 
 
 
213 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1849  hypothetical protein  25.6 
 
 
230 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  35.9 
 
 
1293 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>