58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3112 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  100 
 
 		 744 aa  1441    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  79.06 
 
 		 574 aa  763    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2970  hypothetical protein  74.85 
 
 		 167 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0032208  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1227 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  29.97 
 
 		 3921 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  29.57 
 
 		 1293 aa  104  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  27.88 
 
 		 2573 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1202 aa  100  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  33.21 
 
 		 3471 aa  98.6  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1537 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1332 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  29.4 
 
 		 983 aa  95.1  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  29.01 
 
 		 3634 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1059 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1809 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  25.49 
 
 		 1519 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.55 
 
 		 4896 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1038 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  28.37 
 
 		 1989 aa  64.7  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  29.3 
 
 		 2121 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0667  hypothetical protein  28.32 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.930105  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  25.2 
 
 		 3602 aa  60.8  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  33.33 
 
 		 546 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1927  hypothetical protein  25.24 
 
 		 2748 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  28.03 
 
 		 775 aa  57.4  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  29.57 
 
 		 1168 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  28.17 
 
 		 644 aa  56.6  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1182 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1260  hypothetical protein  27.52 
 
 		 272 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  28.62 
 
 		 3191 aa  54.3  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.88 
 
 		 3419 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  26.99 
 
 		 1857 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 545 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  27.29 
 
 		 2520 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  29.07 
 
 		 5010 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  25.34 
 
 		 807 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  31 
 
 		 1118 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  31.47 
 
 		 587 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  24.58 
 
 		 1150 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  27.43 
 
 		 2520 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  28.22 
 
 		 5017 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  34.11 
 
 		 726 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  29.28 
 
 		 5010 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  31.82 
 
 		 898 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  29.2 
 
 		 5017 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  29.2 
 
 		 5017 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  22.99 
 
 		 2025 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  28.73 
 
 		 5017 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  29.6 
 
 		 5010 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  27.51 
 
 		 2490 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.68 
 
 		 3299 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  31.65 
 
 		 5010 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0343  proprotein convertase P  29.77 
 
 		 730 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000557566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  27.31 
 
 		 5017 aa  44.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1093 aa  44.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1210  conserved repeat domain protein  24.93 
 
 		 617 aa  44.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5456  hypothetical protein  27.62 
 
 		 672 aa  44.3  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  47.06 
 
 		 801 aa  44.3  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>