52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0685 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  100 
 
 
951 aa  1874    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1210  conserved repeat domain protein  26.06 
 
 
617 aa  155  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0727  60 kDa outer membrane protein  25.77 
 
 
554 aa  127  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00741455  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  28.14 
 
 
1519 aa  74.7  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  25 
 
 
1150 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  24.34 
 
 
2573 aa  68.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  24.63 
 
 
3921 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  23.15 
 
 
3602 aa  63.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  23.1 
 
 
1168 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  29.63 
 
 
1038 aa  61.6  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  19.96 
 
 
4896 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  24.58 
 
 
2520 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  24.58 
 
 
2520 aa  55.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  29.61 
 
 
1293 aa  54.3  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  24.52 
 
 
1989 aa  54.3  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  21.12 
 
 
5010 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2196  hypothetical protein  28.41 
 
 
966 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852049  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  30.56 
 
 
1624 aa  52  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  26.86 
 
 
2113 aa  51.6  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  21.85 
 
 
5010 aa  51.2  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  23.92 
 
 
983 aa  50.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  31.91 
 
 
3324 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  24.4 
 
 
5017 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  24.4 
 
 
5017 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  22.64 
 
 
5017 aa  50.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  22.64 
 
 
5017 aa  50.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  27.84 
 
 
1533 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  26.77 
 
 
3471 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  22.7 
 
 
2490 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  21.85 
 
 
2121 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  27.13 
 
 
975 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  27.13 
 
 
939 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  24.36 
 
 
2358 aa  48.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  23.51 
 
 
1857 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2687  conserved repeat domain protein  35.62 
 
 
541 aa  48.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000153291  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  24.36 
 
 
2358 aa  48.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  28.3 
 
 
440 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  28.74 
 
 
2490 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  40.85 
 
 
807 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  31.53 
 
 
907 aa  47.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  29.07 
 
 
2490 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  22.47 
 
 
5017 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  28.74 
 
 
2490 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1456  hypothetical protein  23.96 
 
 
1096 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  24.6 
 
 
5517 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  28.74 
 
 
2485 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  23.95 
 
 
2490 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  26.06 
 
 
5010 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  27.11 
 
 
2912 aa  45.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  24.86 
 
 
543 aa  45.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  20.96 
 
 
5010 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  22.17 
 
 
2713 aa  45.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>