45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1410 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 1038 aa  2109    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2196  hypothetical protein  36.21 
 
 		 966 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852049  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  27.04 
 
 		 1519 aa  89  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  32.43 
 
 		 2573 aa  74.7  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  29.81 
 
 		 1118 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  28.15 
 
 		 744 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  37.78 
 
 		 2713 aa  63.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  37.5 
 
 		 951 aa  59.7  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  35.53 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  31.98 
 
 		 1293 aa  58.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.25 
 
 		 3191 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  27.59 
 
 		 2520 aa  53.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2970  hypothetical protein  35.96 
 
 		 167 aa  52  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0032208  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1227 aa  51.6  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  27.53 
 
 		 1168 aa  51.6  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 1989 aa  51.2  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  36.47 
 
 		 827 aa  51.6  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  25.19 
 
 		 5010 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  26.79 
 
 		 2121 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  26.97 
 
 		 1150 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  25.09 
 
 		 5010 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0727  60 kDa outer membrane protein  24.8 
 
 		 554 aa  50.4  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00741455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  32.04 
 
 		 587 aa  49.3  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  33.33 
 
 		 826 aa  48.9  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  23.87 
 
 		 5010 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1537 aa  48.5  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  24.36 
 
 		 5017 aa  48.5  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  24.36 
 
 		 5017 aa  48.5  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  25.61 
 
 		 983 aa  48.1  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1202 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  22.97 
 
 		 5010 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  27.64 
 
 		 907 aa  46.2  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  30.1 
 
 		 3634 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  25.62 
 
 		 2520 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  35.06 
 
 		 2118 aa  45.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  24.66 
 
 		 5017 aa  45.8  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  24.66 
 
 		 5017 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  25.32 
 
 		 1750 aa  45.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  29.12 
 
 		 3921 aa  45.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2687  conserved repeat domain protein  30.36 
 
 		 541 aa  45.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000153291  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  28.26 
 
 		 1857 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  28.42 
 
 		 3471 aa  44.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  32 
 
 		 3324 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  30.68 
 
 		 3602 aa  45.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  28.18 
 
 		 2489 aa  44.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>