117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4226 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 983 aa  1855    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  48.73 
 
 		 753 aa  263  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  48.27 
 
 		 727 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  31.64 
 
 		 3602 aa  215  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  34.76 
 
 		 3921 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.35 
 
 		 3471 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  31.87 
 
 		 1293 aa  175  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  36.14 
 
 		 2573 aa  174  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  30.01 
 
 		 1332 aa  162  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  31.66 
 
 		 1989 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1227 aa  138  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  29.4 
 
 		 744 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1059 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  28.8 
 
 		 4896 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1537 aa  101  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1809 aa  99.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  30.55 
 
 		 3634 aa  97.8  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1202 aa  90.5  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  27.86 
 
 		 1150 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  33.6 
 
 		 3191 aa  89.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  44.59 
 
 		 907 aa  84.7  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  26.43 
 
 		 1519 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  29.02 
 
 		 1168 aa  83.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  31 
 
 		 1118 aa  82.8  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  24.4 
 
 		 5017 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  24.4 
 
 		 5017 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  24.09 
 
 		 5017 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  29.67 
 
 		 3911 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  27.23 
 
 		 4897 aa  79.7  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  29.8 
 
 		 574 aa  79  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  25.21 
 
 		 2490 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  23.25 
 
 		 5017 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  23.43 
 
 		 2489 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  24.26 
 
 		 5017 aa  74.7  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  24.69 
 
 		 2490 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  23.65 
 
 		 5010 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  24.2 
 
 		 5010 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  25.81 
 
 		 5010 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  24.12 
 
 		 5010 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0193  hypothetical protein  29.41 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  35.9 
 
 		 2005 aa  68.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  31.16 
 
 		 775 aa  68.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  31.19 
 
 		 2121 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  27.35 
 
 		 2113 aa  67.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  26.87 
 
 		 2520 aa  66.6  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  25.92 
 
 		 2358 aa  67  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0667  hypothetical protein  29.57 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.930105  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  26.79 
 
 		 1857 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  25.48 
 
 		 2490 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  27.39 
 
 		 1533 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  26.18 
 
 		 2520 aa  64.7  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  26.56 
 
 		 924 aa  63.9  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  25.1 
 
 		 2490 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  32.68 
 
 		 587 aa  63.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3737 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  24.93 
 
 		 2490 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  25.21 
 
 		 2485 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  24.35 
 
 		 2487 aa  61.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  30.86 
 
 		 3486 aa  60.1  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  24.41 
 
 		 2358 aa  59.3  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  35.38 
 
 		 621 aa  59.7  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  26.23 
 
 		 909 aa  58.9  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1441 aa  58.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  44.68 
 
 		 827 aa  57.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  25.14 
 
 		 3324 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  29.83 
 
 		 807 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  24.49 
 
 		 2490 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  27.87 
 
 		 8918 aa  57  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2970  hypothetical protein  32.3 
 
 		 167 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0032208  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  27.52 
 
 		 853 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 436 aa  54.7  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  32.82 
 
 		 2487 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  39.06 
 
 		 726 aa  54.3  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  34.21 
 
 		 612 aa  54.3  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 900 aa  54.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  32.84 
 
 		 3373 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  32.14 
 
 		 5544 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  23.98 
 
 		 3771 aa  52.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1624 aa  52.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  29.55 
 
 		 2912 aa  52.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1260  hypothetical protein  31.1 
 
 		 272 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  30.66 
 
 		 429 aa  52  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  26.15 
 
 		 3394 aa  52  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  28.12 
 
 		 1378 aa  51.6  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1898 aa  51.2  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  49.02 
 
 		 1337 aa  51.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  42.37 
 
 		 545 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  49.02 
 
 		 1337 aa  51.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1927  hypothetical protein  25.33 
 
 		 2748 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  39.33 
 
 		 801 aa  49.3  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  44.29 
 
 		 1727 aa  49.3  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1210  conserved repeat domain protein  25.16 
 
 		 617 aa  48.9  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4916  hypothetical protein  27.54 
 
 		 283 aa  48.9  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  28.3 
 
 		 1066 aa  48.5  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0148  conserved repeat domain protein  31.43 
 
 		 2553 aa  48.5  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  28.83 
 
 		 1516 aa  48.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  35.29 
 
 		 826 aa  48.1  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  39.74 
 
 		 2656 aa  47.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  34.29 
 
 		 1263 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>