74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09240 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  100 
 
 		 2912 aa  5593    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  27.87 
 
 		 2573 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  36.93 
 
 		 8918 aa  369  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  39.26 
 
 		 1989 aa  333  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  38.2 
 
 		 2078 aa  313  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.81 
 
 		 4896 aa  309  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  38.33 
 
 		 3634 aa  299  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  34.52 
 
 		 3486 aa  260  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  33.22 
 
 		 3920 aa  189  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  24.12 
 
 		 3602 aa  99.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1665 aa  93.2  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  41.11 
 
 		 801 aa  88.6  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  32.94 
 
 		 3793 aa  86.7  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  22.07 
 
 		 2490 aa  78.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  29.74 
 
 		 2604 aa  75.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  27.67 
 
 		 5203 aa  72.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  24.09 
 
 		 2520 aa  72  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  40.87 
 
 		 2487 aa  72  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  25.25 
 
 		 2490 aa  71.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  35.52 
 
 		 440 aa  69.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  25.95 
 
 		 2487 aa  68.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  27.59 
 
 		 3911 aa  68.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  26.68 
 
 		 2113 aa  67.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  28.63 
 
 		 1118 aa  67.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  25.44 
 
 		 2490 aa  65.9  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  24.24 
 
 		 2485 aa  65.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  24.75 
 
 		 2490 aa  65.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  37.72 
 
 		 3191 aa  64.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1624 aa  63.9  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  27.93 
 
 		 3394 aa  63.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  36.02 
 
 		 1441 aa  62.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  23.47 
 
 		 2358 aa  62.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  33.49 
 
 		 3373 aa  62.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  23.47 
 
 		 2358 aa  61.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_205  hypothetical protein  32 
 
 		 653 aa  60.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  23.47 
 
 		 2490 aa  60.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1898 aa  60.1  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  24.46 
 
 		 2490 aa  60.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  27.91 
 
 		 5166 aa  60.1  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  34.71 
 
 		 3927 aa  59.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  24.59 
 
 		 2520 aa  58.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  30.81 
 
 		 2000 aa  57.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  34.24 
 
 		 1168 aa  57  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  23.15 
 
 		 3471 aa  57  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1537 aa  56.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1097  hypothetical protein  27.51 
 
 		 743 aa  56.2  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0127876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  24.42 
 
 		 2121 aa  55.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  29.44 
 
 		 1150 aa  55.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  31.63 
 
 		 924 aa  56.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1021 aa  55.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  29.45 
 
 		 1533 aa  55.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  23.39 
 
 		 2489 aa  54.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1946 aa  54.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  23.43 
 
 		 5017 aa  53.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  29.18 
 
 		 4013 aa  53.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1202 aa  52.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4228  conserved repeat domain protein  42.06 
 
 		 2395 aa  52.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.687969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  29.4 
 
 		 983 aa  52  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  31.93 
 
 		 775 aa  51.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  28.05 
 
 		 3921 aa  50.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.3 
 
 		 2724 aa  50.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2713 aa  49.7  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  26.18 
 
 		 5017 aa  49.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  26.18 
 
 		 5017 aa  49.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  25.17 
 
 		 429 aa  48.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  23.09 
 
 		 5017 aa  48.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  23.19 
 
 		 1857 aa  47.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 		 5010 aa  47  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  41.03 
 
 		 827 aa  47  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  28.32 
 
 		 1015 aa  47  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  24.88 
 
 		 5010 aa  46.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0727  60 kDa outer membrane protein  26.91 
 
 		 554 aa  46.6  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00741455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.91 
 
 		 3816 aa  46.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  27.14 
 
 		 898 aa  46.2  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>