104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1880 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  100 
 
 
440 aa  802    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  35.61 
 
 
1150 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0193  hypothetical protein  32.23 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  34.23 
 
 
2121 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  33.17 
 
 
1168 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  33.78 
 
 
1857 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  30 
 
 
2520 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  30 
 
 
2520 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  29.55 
 
 
2113 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  34.8 
 
 
5017 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  34.8 
 
 
5017 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  29.55 
 
 
1533 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  34.88 
 
 
1989 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  32.58 
 
 
2490 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  32.58 
 
 
3634 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  33.06 
 
 
2573 aa  73.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5065  hypothetical protein  41.67 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.201013  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  41.23 
 
 
840 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  32.6 
 
 
5010 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  32.6 
 
 
5017 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  32.32 
 
 
1537 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  32.6 
 
 
5017 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  33.33 
 
 
3191 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  33.04 
 
 
5017 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  29.2 
 
 
5010 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  31.67 
 
 
2490 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  37.42 
 
 
617 aa  70.1  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  31.22 
 
 
2358 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  31.22 
 
 
2358 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  32.13 
 
 
2490 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  31.22 
 
 
2490 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  30.58 
 
 
1519 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  31.22 
 
 
2490 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  35.52 
 
 
2912 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  30.09 
 
 
5010 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 
2485 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  26.86 
 
 
1293 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  27.88 
 
 
5010 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  28.76 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.55 
 
 
4896 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  30.8 
 
 
1118 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  27.38 
 
 
3602 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  29.86 
 
 
2487 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 
2490 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  27.75 
 
 
2489 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  47.71 
 
 
504 aa  63.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  33.06 
 
 
3911 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  30.37 
 
 
3486 aa  61.6  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  31.02 
 
 
3921 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  45.86 
 
 
904 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  30.8 
 
 
983 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 
846 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  33.18 
 
 
909 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  28.14 
 
 
8918 aa  57.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  30.8 
 
 
1332 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  39.56 
 
 
5544 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  24.82 
 
 
1441 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  40.95 
 
 
551 aa  53.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  31.47 
 
 
1809 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  30.88 
 
 
924 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  24.58 
 
 
1898 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  38.31 
 
 
555 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  31.75 
 
 
3324 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  26.83 
 
 
4013 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  36.24 
 
 
582 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  30.07 
 
 
2005 aa  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  34.21 
 
 
1624 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf584  virulence-associated lipoprotein MIA  37.25 
 
 
255 aa  49.7  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0652484  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  30.17 
 
 
1000 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  31.3 
 
 
775 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  29.87 
 
 
621 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12456  frustulin 5  46.97 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.240417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3701  conserved repeat domain protein  34.38 
 
 
194 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0727  60 kDa outer membrane protein  26.98 
 
 
554 aa  47.8  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00741455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  36.05 
 
 
826 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  66.67 
 
 
793 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  33.52 
 
 
1059 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  27.53 
 
 
1202 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  42.5 
 
 
1217 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  29.92 
 
 
3471 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  37.11 
 
 
5166 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  50.64 
 
 
1159 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  47.27 
 
 
5203 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  28 
 
 
1757 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  27.54 
 
 
1665 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  29.37 
 
 
2078 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  31.58 
 
 
2118 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  39.02 
 
 
2179 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1264  conserved repeat domain protein  28.66 
 
 
686 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  30.14 
 
 
2853 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0148  conserved repeat domain protein  28.99 
 
 
2553 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  35.42 
 
 
630 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  30.34 
 
 
587 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  31.52 
 
 
602 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  28.43 
 
 
5517 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0685  conserved repeat domain protein  25.48 
 
 
951 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  27.36 
 
 
2000 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1246  flagella protein  32.94 
 
 
706 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.774544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  27.88 
 
 
3394 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  37.72 
 
 
1096 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>