64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11500 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  100 
 
 		 3920 aa  7579    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0104  cell wall/surface repeat protein  36.41 
 
 		 2099 aa  394  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.2 
 
 		 2744 aa  287  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.76 
 
 		 3589 aa  222  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  32.52 
 
 		 2716 aa  208  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  27.46 
 
 		 2271 aa  200  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1994 aa  196  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.09 
 
 		 4896 aa  192  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  33.22 
 
 		 2912 aa  189  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  32.5 
 
 		 8918 aa  184  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.74 
 
 		 4855 aa  179  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  32.76 
 
 		 3634 aa  159  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  32.19 
 
 		 2078 aa  156  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  28.42 
 
 		 3486 aa  138  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  31.39 
 
 		 1989 aa  136  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11480  conserved repeat protein  31.83 
 
 		 1893 aa  117  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.42 
 
 		 2296 aa  115  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.28 
 
 		 2927 aa  107  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.06 
 
 		 1275 aa  95.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  27.6 
 
 		 1526 aa  90.1  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  25.63 
 
 		 4897 aa  81.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  25.91 
 
 		 3471 aa  81.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.32 
 
 		 5613 aa  79  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.15 
 
 		 1672 aa  73.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  33.04 
 
 		 801 aa  71.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  29.82 
 
 		 4013 aa  71.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.78 
 
 		 4500 aa  70.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1665 aa  70.9  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.34 
 
 		 2724 aa  69.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.17 
 
 		 1637 aa  64.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  30.63 
 
 		 1447 aa  63.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  24.19 
 
 		 5010 aa  62.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  25.1 
 
 		 2604 aa  59.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  27.71 
 
 		 2113 aa  58.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  24.51 
 
 		 2520 aa  57.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  25.05 
 
 		 1857 aa  56.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  24.62 
 
 		 2520 aa  55.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  24.22 
 
 		 5010 aa  54.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  24.53 
 
 		 1999 aa  53.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  29.48 
 
 		 1451 aa  53.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  37 
 
 		 2487 aa  52.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  27.32 
 
 		 3911 aa  52.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  35.9 
 
 		 3793 aa  53.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  42.5 
 
 		 2713 aa  52.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  43.84 
 
 		 3191 aa  52.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  24.76 
 
 		 2485 aa  51.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  20 
 
 		 2490 aa  51.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  20.16 
 
 		 2490 aa  52  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  22.46 
 
 		 1363 aa  51.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  41.56 
 
 		 3927 aa  50.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  23.77 
 
 		 2489 aa  50.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  29.02 
 
 		 827 aa  50.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  20 
 
 		 2490 aa  49.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  22.78 
 
 		 5010 aa  49.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  24.73 
 
 		 3360 aa  48.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1946 aa  48.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1441 aa  49.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  22.37 
 
 		 2490 aa  48.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  19.84 
 
 		 2358 aa  48.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  19.84 
 
 		 2358 aa  48.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  24.54 
 
 		 2121 aa  48.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  22.89 
 
 		 2490 aa  48.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  23.24 
 
 		 2487 aa  47.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  23.34 
 
 		 5010 aa  46.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>