44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1060 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  26.99 
 
 
3771 aa  741    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  100 
 
 
4897 aa  9409    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  26.52 
 
 
3360 aa  540  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  26.11 
 
 
3471 aa  332  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  26.37 
 
 
3602 aa  162  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  24.55 
 
 
4896 aa  162  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  24.58 
 
 
2358 aa  122  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  24.52 
 
 
2358 aa  120  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  23.89 
 
 
2490 aa  118  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  23.38 
 
 
2490 aa  112  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  23.66 
 
 
2490 aa  110  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  23.43 
 
 
2487 aa  106  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  25.24 
 
 
1441 aa  104  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  23.52 
 
 
2490 aa  103  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  25.9 
 
 
1332 aa  100  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  24.49 
 
 
2573 aa  93.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  23.31 
 
 
2490 aa  89  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  46.91 
 
 
2853 aa  86.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  22.84 
 
 
2489 aa  84.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  25.63 
 
 
3920 aa  82  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  44.44 
 
 
2886 aa  80.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  23.88 
 
 
2485 aa  80.5  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  28.42 
 
 
1118 aa  79  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  42.86 
 
 
3634 aa  79.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  42.86 
 
 
2078 aa  79  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  25.31 
 
 
1898 aa  78.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  26.18 
 
 
1059 aa  78.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  42.86 
 
 
3486 aa  75.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.01 
 
 
2724 aa  73.9  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  23.57 
 
 
8918 aa  73.6  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  44.16 
 
 
1946 aa  73.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  26.93 
 
 
983 aa  72.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  40.24 
 
 
1809 aa  71.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  26.32 
 
 
2490 aa  65.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  28.73 
 
 
1989 aa  62  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  27.5 
 
 
1293 aa  60.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  25.8 
 
 
975 aa  55.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.9 
 
 
939 aa  54.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  23.31 
 
 
3521 aa  51.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  29.07 
 
 
509 aa  51.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  23.61 
 
 
3471 aa  50.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  26.99 
 
 
1757 aa  50.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  27.04 
 
 
2434 aa  48.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  25.63 
 
 
3911 aa  47  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>