123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13653 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  100 
 
 		 1665 aa  3108    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  62.68 
 
 		 8918 aa  1345    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  30.37 
 
 		 2604 aa  234  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  26.06 
 
 		 5544 aa  202  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  44.77 
 
 		 2487 aa  190  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  42.08 
 
 		 3191 aa  181  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  27.99 
 
 		 5517 aa  180  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  30.24 
 
 		 5203 aa  178  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  29.32 
 
 		 5166 aa  169  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28.74 
 
 		 3373 aa  162  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  30.12 
 
 		 2656 aa  152  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  33.79 
 
 		 1337 aa  151  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  33.79 
 
 		 1337 aa  151  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  27.05 
 
 		 2112 aa  135  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  42.69 
 
 		 3634 aa  130  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  24.01 
 
 		 1531 aa  129  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  27.03 
 
 		 733 aa  126  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  35.04 
 
 		 4896 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  29.41 
 
 		 2047 aa  120  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  41.55 
 
 		 2078 aa  120  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  51.89 
 
 		 2478 aa  115  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  45.83 
 
 		 2588 aa  111  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  45.28 
 
 		 2602 aa  107  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  30.21 
 
 		 2876 aa  100  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  32.88 
 
 		 733 aa  96.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  29.87 
 
 		 3602 aa  94  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  30.53 
 
 		 2005 aa  94.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  39.09 
 
 		 2912 aa  94.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  32.16 
 
 		 1483 aa  90.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  26.44 
 
 		 1263 aa  88.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  26.24 
 
 		 2625 aa  86.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  30.25 
 
 		 2890 aa  85.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  26.56 
 
 		 2456 aa  85.5  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  33.03 
 
 		 1989 aa  83.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1461 aa  83.2  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  27.84 
 
 		 5094 aa  82  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  34.13 
 
 		 3920 aa  80.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  32.66 
 
 		 1153 aa  80.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  32.66 
 
 		 1153 aa  80.5  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  27.27 
 
 		 3927 aa  79.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  26.79 
 
 		 599 aa  79  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  33.82 
 
 		 3486 aa  77.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  41.82 
 
 		 2064 aa  75.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  27.42 
 
 		 1976 aa  75.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  31.88 
 
 		 315 aa  71.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  37.74 
 
 		 3737 aa  70.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  27.52 
 
 		 2795 aa  68.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  39.34 
 
 		 3324 aa  68.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  40.95 
 
 		 871 aa  67.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  31.68 
 
 		 2022 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  24.49 
 
 		 4013 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1547 aa  67  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  38.54 
 
 		 2377 aa  67  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  40.78 
 
 		 3793 aa  65.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1727 aa  64.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  43.04 
 
 		 1162 aa  64.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  38.46 
 
 		 852 aa  64.7  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  40.78 
 
 		 676 aa  64.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  40 
 
 		 1059 aa  63.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  26.13 
 
 		 2990 aa  63.9  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  46.34 
 
 		 1021 aa  63.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  39 
 
 		 815 aa  61.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.95 
 
 		 3471 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  31.58 
 
 		 750 aa  61.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1139 aa  61.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1064 aa  60.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  26.42 
 
 		 1243 aa  60.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  45.45 
 
 		 799 aa  60.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  29.81 
 
 		 5337 aa  59.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  28.02 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  37.5 
 
 		 822 aa  59.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  39.51 
 
 		 2772 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1946 aa  58.2  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1259 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  38.64 
 
 		 2421 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.82 
 
 		 2927 aa  57.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  31.4 
 
 		 1371 aa  57.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  36.36 
 
 		 2367 aa  57  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  38.64 
 
 		 2454 aa  57  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  33.79 
 
 		 965 aa  56.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  33.79 
 
 		 965 aa  56.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  34.52 
 
 		 637 aa  57  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  36.36 
 
 		 2411 aa  56.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  38.64 
 
 		 2807 aa  56.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  39.58 
 
 		 801 aa  55.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  35.92 
 
 		 1008 aa  55.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  34.84 
 
 		 586 aa  55.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  34.38 
 
 		 3227 aa  54.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  44 
 
 		 1984 aa  53.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  35 
 
 		 627 aa  53.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  42.67 
 
 		 2000 aa  53.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  31.87 
 
 		 1389 aa  52.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  27.84 
 
 		 4672 aa  52.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  29.21 
 
 		 892 aa  52.4  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1898 aa  52  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  35.63 
 
 		 532 aa  52  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1809 aa  51.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6955  hypothetical protein  31.58 
 
 		 396 aa  51.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  32.29 
 
 		 503 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  41.89 
 
 		 794 aa  50.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>