48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0929 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  100 
 
 
2876 aa  5569    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  71.91 
 
 
2890 aa  2198    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  40.67 
 
 
2112 aa  616  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  29.49 
 
 
5517 aa  255  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  28.97 
 
 
5203 aa  206  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  28.91 
 
 
5166 aa  202  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  26.95 
 
 
5544 aa  195  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  28.34 
 
 
2990 aa  186  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  28.76 
 
 
2604 aa  180  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  34.33 
 
 
1263 aa  166  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  29.05 
 
 
1337 aa  152  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  29.05 
 
 
1337 aa  152  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  46.01 
 
 
759 aa  139  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  33.06 
 
 
733 aa  135  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  26.52 
 
 
2656 aa  118  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  29.13 
 
 
1727 aa  110  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  35.52 
 
 
3324 aa  109  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28.94 
 
 
3373 aa  108  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  30.66 
 
 
1153 aa  95.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  30.66 
 
 
1153 aa  95.9  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  23.19 
 
 
733 aa  91.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  27.2 
 
 
2047 aa  87.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  34.86 
 
 
1315 aa  82.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  30.05 
 
 
666 aa  82  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  25.08 
 
 
1531 aa  79.7  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  28.64 
 
 
8918 aa  79.3  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  30.71 
 
 
965 aa  73.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  30.71 
 
 
965 aa  73.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  27.48 
 
 
1665 aa  72.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  30.29 
 
 
1243 aa  69.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  28.79 
 
 
892 aa  68.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  30.93 
 
 
3394 aa  65.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  31.12 
 
 
870 aa  64.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  26.57 
 
 
1519 aa  62  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  28.99 
 
 
813 aa  57.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  26.63 
 
 
436 aa  56.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  35 
 
 
892 aa  55.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  28.37 
 
 
586 aa  53.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.94 
 
 
371 aa  53.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0186  hypothetical protein  40.86 
 
 
282 aa  52.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  33.06 
 
 
130 aa  51.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  27.27 
 
 
1314 aa  50.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.74 
 
 
1336 aa  49.7  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  32.71 
 
 
1809 aa  49.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  25.48 
 
 
382 aa  48.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  31.11 
 
 
917 aa  48.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  40.51 
 
 
1150 aa  47.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  30.56 
 
 
916 aa  47  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0234116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>