44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3498 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  100 
 
 
1531 aa  2962    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  38.24 
 
 
733 aa  436  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  25.44 
 
 
5166 aa  179  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  26.19 
 
 
5203 aa  176  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  27.3 
 
 
2656 aa  172  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  24.21 
 
 
8918 aa  149  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  23.33 
 
 
5517 aa  147  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  24.75 
 
 
3373 aa  134  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  24.6 
 
 
5544 aa  118  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  24.73 
 
 
2604 aa  106  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  24.91 
 
 
1337 aa  89.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  24.91 
 
 
1337 aa  89.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  23.84 
 
 
1665 aa  80.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  22.61 
 
 
2047 aa  80.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  27.17 
 
 
2890 aa  78.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  24.88 
 
 
2876 aa  78.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  25.75 
 
 
1243 aa  77  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  23.79 
 
 
2990 aa  74.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  24.85 
 
 
666 aa  73.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  25.71 
 
 
1727 aa  73.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  26.85 
 
 
1263 aa  72.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.04 
 
 
1336 aa  69.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  25.98 
 
 
586 aa  63.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  29.23 
 
 
436 aa  62.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  32.64 
 
 
733 aa  62  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  37.76 
 
 
440 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  25.85 
 
 
2112 aa  59.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  27.6 
 
 
870 aa  56.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  32.73 
 
 
436 aa  53.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  32.73 
 
 
436 aa  53.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  36.59 
 
 
2713 aa  53.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  27.06 
 
 
3324 aa  52.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  48.08 
 
 
604 aa  52.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  27.59 
 
 
1667 aa  50.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  24.61 
 
 
1153 aa  50.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  24.61 
 
 
1153 aa  50.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  38.75 
 
 
130 aa  49.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  35.35 
 
 
1809 aa  48.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  30.56 
 
 
965 aa  48.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  30.65 
 
 
1314 aa  48.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  30.56 
 
 
965 aa  48.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  28.32 
 
 
2176 aa  46.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3593  hypothetical protein  36.99 
 
 
695 aa  45.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.33 
 
 
371 aa  45.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>