65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0207 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  100 
 
 		 892 aa  1768    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  44.61 
 
 		 1153 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  44.61 
 
 		 1153 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  38.97 
 
 		 965 aa  306  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  38.97 
 
 		 965 aa  306  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  59.29 
 
 		 1337 aa  249  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  59.29 
 
 		 1337 aa  249  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  39.08 
 
 		 2604 aa  138  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  36.97 
 
 		 5517 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.63 
 
 		 3324 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  34.07 
 
 		 5544 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  36.19 
 
 		 2990 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  34.38 
 
 		 5166 aa  97.8  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  33.81 
 
 		 5203 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  35.62 
 
 		 1263 aa  94  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0812  cell wall anchor domain-containing protein  25.89 
 
 		 905 aa  92.8  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0245674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0828  cell wall anchor domain-containing protein  25.89 
 
 		 905 aa  92.8  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.620936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2654  cell wall anchor domain-containing protein  25.82 
 
 		 877 aa  90.5  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2710  cell wall anchor domain-containing protein  25.82 
 
 		 877 aa  90.5  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  37.5 
 
 		 733 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  34.15 
 
 		 436 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1727 aa  86.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  31.55 
 
 		 3373 aa  85.1  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  32.37 
 
 		 2112 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 2047 aa  81.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  30.63 
 
 		 666 aa  80.1  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2577  cell wall anchor domain-containing protein  23.91 
 
 		 961 aa  77.4  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2525  cell wall anchor domain-containing protein  23.91 
 
 		 961 aa  77.4  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  32.09 
 
 		 2656 aa  70.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0082  hypothetical protein  24.8 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2578  cell wall anchor domain-containing protein  23.39 
 
 		 1038 aa  68.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2526  cell wall anchor domain-containing protein  23.39 
 
 		 1038 aa  68.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  28.79 
 
 		 2876 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  24.4 
 
 		 1519 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  27.43 
 
 		 2890 aa  62  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  30.63 
 
 		 1243 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  50 
 
 		 1150 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  39.09 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  50 
 
 		 1168 aa  58.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  30.61 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.48 
 
 		 502 aa  55.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  30.22 
 
 		 727 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  32.37 
 
 		 940 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1809 aa  52  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  45 
 
 		 917 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  39.06 
 
 		 440 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1757 aa  51.2  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6956  hypothetical protein  32.11 
 
 		 280 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3513  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.62 
 
 		 850 aa  48.9  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  39.29 
 
 		 333 aa  48.5  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  29.03 
 
 		 501 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 436 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  37.5 
 
 		 892 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  37.5 
 
 		 436 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  30.37 
 
 		 914 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  33.04 
 
 		 813 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  26.53 
 
 		 983 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  34.25 
 
 		 3634 aa  45.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  26.79 
 
 		 2272 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1537 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  46 
 
 		 941 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0220  hypothetical protein  38.3 
 
 		 948 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000317657  normal  0.15907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  25.81 
 
 		 1531 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  23.75 
 
 		 1058 aa  45.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  46 
 
 		 940 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>