59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2040 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  100 
 
 		 2022 aa  4071    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  26.52 
 
 		 4013 aa  206  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  36.08 
 
 		 2267 aa  72  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  40.43 
 
 		 2064 aa  71.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1547 aa  69.7  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  33.66 
 
 		 2005 aa  69.3  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  39.13 
 
 		 315 aa  68.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.08 
 
 		 3191 aa  68.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.32 
 
 		 4896 aa  67.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  34.58 
 
 		 2588 aa  68.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  34.69 
 
 		 3602 aa  67.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.66 
 
 		 3737 aa  68.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1665 aa  67.4  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.65 
 
 		 3927 aa  67.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  35 
 
 		 2421 aa  67.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  33.02 
 
 		 2487 aa  67  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  35 
 
 		 2411 aa  66.6  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  32.67 
 
 		 2602 aa  66.6  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  35 
 
 		 2367 aa  66.6  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  35 
 
 		 2454 aa  66.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  35.79 
 
 		 2478 aa  65.9  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  34 
 
 		 2772 aa  65.9  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  35 
 
 		 2807 aa  65.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  38.04 
 
 		 2927 aa  65.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  38.04 
 
 		 1259 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1059 aa  63.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  30.43 
 
 		 3471 aa  62.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  28.83 
 
 		 5745 aa  62.4  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  31.68 
 
 		 599 aa  62  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  32.67 
 
 		 750 aa  60.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  34.69 
 
 		 1526 aa  59.7  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  37.97 
 
 		 822 aa  59.3  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  30.23 
 
 		 3324 aa  57.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.7 
 
 		 2296 aa  58.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.7 
 
 		 3227 aa  57.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  31.63 
 
 		 815 aa  55.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  35.87 
 
 		 1066 aa  54.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  48.89 
 
 		 637 aa  53.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  30.61 
 
 		 1371 aa  53.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1461 aa  52.8  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  33.75 
 
 		 799 aa  52.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1064 aa  51.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27 
 
 		 2377 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  28.57 
 
 		 540 aa  51.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  28.71 
 
 		 711 aa  51.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  29.29 
 
 		 3793 aa  50.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1139 aa  50.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 503 aa  50.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  30.11 
 
 		 561 aa  49.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  32.43 
 
 		 627 aa  49.3  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  31.91 
 
 		 694 aa  48.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1032 aa  48.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  36.49 
 
 		 1162 aa  48.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  39.47 
 
 		 794 aa  47.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  35.05 
 
 		 1140 aa  47.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  31.65 
 
 		 792 aa  46.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  20.79 
 
 		 1340 aa  46.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  33.67 
 
 		 650 aa  46.2  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.77 
 
 		 1225 aa  45.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>