141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06070 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  100 
 
 		 676 aa  1351    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 612 aa  124  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  43.16 
 
 		 871 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  29.86 
 
 		 1129 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  42.86 
 
 		 2005 aa  78.2  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  42.11 
 
 		 3793 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  41.9 
 
 		 2487 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1461  hypothetical protein  27.2 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000257739  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01070  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1030 aa  68.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  28.95 
 
 		 2364 aa  68.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  41.67 
 
 		 3602 aa  67.4  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  40.22 
 
 		 532 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  36.22 
 
 		 1345 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  38.89 
 
 		 815 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1461 aa  65.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  38.2 
 
 		 3737 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  39.02 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  44.87 
 
 		 711 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1665 aa  63.9  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 		 3324 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  36.61 
 
 		 1259 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  39.51 
 
 		 969 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  39.51 
 
 		 963 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  29.88 
 
 		 2478 aa  62  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1547 aa  62.4  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  26.46 
 
 		 3921 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  41.57 
 
 		 4071 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  38.55 
 
 		 5745 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  27.66 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  40.59 
 
 		 886 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.11 
 
 		 4896 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  29.52 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  36.11 
 
 		 968 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  34.58 
 
 		 3927 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  42.67 
 
 		 2833 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  28.77 
 
 		 794 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  37.23 
 
 		 750 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  38.14 
 
 		 2064 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  35.88 
 
 		 2588 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.74 
 
 		 2377 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  42.62 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  35.85 
 
 		 694 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  28.12 
 
 		 2772 aa  57.4  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  25.48 
 
 		 1293 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  36.84 
 
 		 885 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  37.66 
 
 		 3471 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1059 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  34.31 
 
 		 3191 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  28.09 
 
 		 2267 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  34.78 
 
 		 535 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  31.01 
 
 		 3227 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  22.44 
 
 		 775 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0395  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  21.43 
 
 		 801 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  38.3 
 
 		 822 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  36.36 
 
 		 599 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  35.53 
 
 		 799 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1313 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  30.5 
 
 		 2602 aa  55.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  31.91 
 
 		 1371 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  26.42 
 
 		 429 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  41.25 
 
 		 2421 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  41.25 
 
 		 2454 aa  53.9  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  24.82 
 
 		 2972 aa  54.3  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1488 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  41.25 
 
 		 2367 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  41.25 
 
 		 2807 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  41.25 
 
 		 2411 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  35.9 
 
 		 627 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  34.72 
 
 		 1140 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  43.84 
 
 		 636 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  40.26 
 
 		 792 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0803  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.34 
 
 		 831 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  30.43 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0182  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  24.04 
 
 		 825 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  32.26 
 
 		 490 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28.43 
 
 		 3373 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  23.64 
 
 		 2980 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  32.65 
 
 		 3958 aa  51.6  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  37.78 
 
 		 1602 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  30.97 
 
 		 598 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  37.93 
 
 		 3682 aa  50.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  31.53 
 
 		 650 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  27.68 
 
 		 938 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  32.91 
 
 		 1389 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  32.58 
 
 		 852 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  35.05 
 
 		 642 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  38.89 
 
 		 1230 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  32.53 
 
 		 1483 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  34.44 
 
 		 1162 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 751 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  32.69 
 
 		 967 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  34.09 
 
 		 4013 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  40.74 
 
 		 1466 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  38.6 
 
 		 640 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  31 
 
 		 1222 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  30.49 
 
 		 726 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1139 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  27.27 
 
 		 890 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  30.24 
 
 		 2358 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  30.24 
 
 		 2490 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>