112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0367 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  100 
 
 		 2478 aa  4812    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  50.12 
 
 		 2602 aa  591  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  47.61 
 
 		 2267 aa  496  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  29.92 
 
 		 2588 aa  170  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  33.1 
 
 		 2487 aa  155  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1461 aa  130  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.5 
 
 		 4978 aa  129  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  51 
 
 		 3191 aa  127  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  34.53 
 
 		 2377 aa  121  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.79 
 
 		 4896 aa  116  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  37.44 
 
 		 3793 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  51.89 
 
 		 1665 aa  114  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.85 
 
 		 3471 aa  102  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  44 
 
 		 3602 aa  85.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  40.34 
 
 		 2064 aa  84  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  30.2 
 
 		 3927 aa  83.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  41.75 
 
 		 2005 aa  82  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  33.97 
 
 		 1162 aa  78.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  25.22 
 
 		 5745 aa  76.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  36.21 
 
 		 3737 aa  75.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1139 aa  68.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  35.29 
 
 		 2927 aa  66.6  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  46.43 
 
 		 1269 aa  66.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  35.79 
 
 		 2022 aa  65.9  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1059 aa  65.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  38.95 
 
 		 750 aa  65.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  32.03 
 
 		 2270 aa  65.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  39.64 
 
 		 1367 aa  64.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  36.92 
 
 		 721 aa  65.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  39.62 
 
 		 627 aa  65.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.35 
 
 		 761 aa  64.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  39.23 
 
 		 1269 aa  63.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  28.41 
 
 		 1483 aa  63.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  45.24 
 
 		 1268 aa  63.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  33.61 
 
 		 599 aa  63.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  41.25 
 
 		 2421 aa  62.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  41.25 
 
 		 2367 aa  62  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  31.47 
 
 		 1597 aa  61.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  41.25 
 
 		 2454 aa  61.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  41.25 
 
 		 2411 aa  62  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.98 
 
 		 850 aa  61.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  34.78 
 
 		 2772 aa  60.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  31.3 
 
 		 3227 aa  60.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  40.91 
 
 		 3474 aa  60.1  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  41.25 
 
 		 2807 aa  60.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  36.84 
 
 		 1394 aa  60.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  36.27 
 
 		 1526 aa  60.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1969 aa  60.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  38.76 
 
 		 2839 aa  60.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  44.68 
 
 		 3477 aa  58.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.16 
 
 		 994 aa  58.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  35.29 
 
 		 2296 aa  58.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  35.35 
 
 		 822 aa  58.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.11 
 
 		 2346 aa  58.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1547 aa  58.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  28.01 
 
 		 1363 aa  58.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  43.88 
 
 		 4748 aa  58.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  27.74 
 
 		 2418 aa  58.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  35.16 
 
 		 560 aa  57.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  28.1 
 
 		 871 aa  57.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  34.96 
 
 		 815 aa  57.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  34.43 
 
 		 570 aa  57  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  34.74 
 
 		 1371 aa  56.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.27 
 
 		 2402 aa  56.2  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  25.71 
 
 		 792 aa  55.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  35.24 
 
 		 637 aa  55.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.22 
 
 		 4220 aa  55.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1976 aa  54.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1259 aa  54.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.94 
 
 		 3816 aa  54.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  35.71 
 
 		 4013 aa  54.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  32.35 
 
 		 676 aa  53.5  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1210 aa  53.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  45.26 
 
 		 8321 aa  53.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  35.38 
 
 		 582 aa  53.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  34.68 
 
 		 4854 aa  52.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  36.89 
 
 		 2816 aa  52.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  42.57 
 
 		 4848 aa  52.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  35.71 
 
 		 711 aa  51.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  33.53 
 
 		 892 aa  51.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1193 aa  52  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1980 aa  50.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.72 
 
 		 1867 aa  50.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  26.79 
 
 		 794 aa  50.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  34.57 
 
 		 799 aa  50.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  28.57 
 
 		 594 aa  50.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1066 aa  50.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  38.1 
 
 		 3324 aa  50.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  43.75 
 
 		 1143 aa  50.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  25.65 
 
 		 532 aa  49.7  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2566  hypothetical protein  39.76 
 
 		 951 aa  48.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1064 aa  48.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  36.26 
 
 		 1287 aa  49.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  41.67 
 
 		 1022 aa  48.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.46 
 
 		 2114 aa  48.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 315 aa  49.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  34.19 
 
 		 1606 aa  48.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  29.41 
 
 		 1008 aa  48.9  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.61 
 
 		 3089 aa  47.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  35.71 
 
 		 653 aa  48.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>