74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000064 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  100 
 
 
594 aa  1221    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  48.9 
 
 
582 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  45.32 
 
 
560 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  41.27 
 
 
1027 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  38.22 
 
 
1022 aa  282  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  32.35 
 
 
653 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  30.88 
 
 
653 aa  200  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  31.67 
 
 
653 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4369  hypothetical protein  30.09 
 
 
646 aa  73.9  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  36.36 
 
 
1268 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  39.39 
 
 
1597 aa  67.8  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  26.59 
 
 
765 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  33.64 
 
 
1269 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  34.55 
 
 
1269 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  40.98 
 
 
3474 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  36.51 
 
 
3477 aa  62  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  28.93 
 
 
1040 aa  61.6  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  28.12 
 
 
601 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.71 
 
 
2816 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  37.23 
 
 
721 aa  58.9  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.08 
 
 
2114 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.93 
 
 
4220 aa  55.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.45 
 
 
2346 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  35.23 
 
 
814 aa  53.9  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  40 
 
 
4978 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  34.78 
 
 
1538 aa  52  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.67 
 
 
2377 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.5 
 
 
3927 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  36.05 
 
 
4848 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  28.57 
 
 
2478 aa  50.8  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  23.18 
 
 
1178 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  38.27 
 
 
2602 aa  50.4  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  30.28 
 
 
1215 aa  50.4  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.43 
 
 
3089 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  30.28 
 
 
1215 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  36.89 
 
 
1706 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  34 
 
 
2267 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2894  lectin repeat domain protein  22.7 
 
 
801 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.106224  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  31.43 
 
 
1911 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.12 
 
 
1109 aa  48.9  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  46 
 
 
1884 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  35.44 
 
 
1712 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  30.99 
 
 
2476 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  37.89 
 
 
1394 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  31.33 
 
 
4854 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  32.93 
 
 
8321 aa  47  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  33.33 
 
 
2848 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  37.5 
 
 
1363 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 
2839 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  32.67 
 
 
5745 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  31.78 
 
 
4896 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2698  Ricin B lectin  22.67 
 
 
803 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0894708  normal  0.0551726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  46.81 
 
 
157 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.73 
 
 
994 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  36.07 
 
 
2192 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.87 
 
 
1215 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  34.48 
 
 
1126 aa  45.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
1287 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  34.12 
 
 
892 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  28.87 
 
 
1215 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.3 
 
 
2503 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31 
 
 
3191 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  36.23 
 
 
3544 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  27.91 
 
 
4748 aa  44.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.05 
 
 
3816 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.52 
 
 
3396 aa  44.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.65 
 
 
850 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.99 
 
 
3699 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.17 
 
 
1215 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  23.17 
 
 
1024 aa  43.9  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
16322 aa  43.9  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  36.21 
 
 
715 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  29.41 
 
 
492 aa  43.9  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  35.64 
 
 
974 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>