255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0798 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  100 
 
 
3474 aa  6832    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  35.76 
 
 
3699 aa  609  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.13 
 
 
3544 aa  548  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.13 
 
 
3699 aa  531  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  52.9 
 
 
3477 aa  510  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  38.59 
 
 
2839 aa  459  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  52.69 
 
 
2233 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.73 
 
 
3927 aa  365  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.99 
 
 
5745 aa  362  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  29.71 
 
 
4231 aa  359  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  32.34 
 
 
4978 aa  357  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  32.73 
 
 
4848 aa  351  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.66 
 
 
3191 aa  347  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  34.43 
 
 
2853 aa  345  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  35.03 
 
 
2820 aa  340  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  42.6 
 
 
1597 aa  308  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  30.78 
 
 
4465 aa  285  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  31.6 
 
 
2074 aa  279  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  33.21 
 
 
1269 aa  269  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  33.25 
 
 
1268 aa  261  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  37 
 
 
2522 aa  261  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  33.49 
 
 
1269 aa  257  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.77 
 
 
11716 aa  257  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.79 
 
 
1884 aa  249  6e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  38.87 
 
 
2816 aa  244  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  25.73 
 
 
9867 aa  223  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.02 
 
 
2114 aa  211  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.46 
 
 
3363 aa  210  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  33.12 
 
 
721 aa  209  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.38 
 
 
4220 aa  209  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  36.65 
 
 
16322 aa  208  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  33.8 
 
 
2767 aa  207  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  44.26 
 
 
1757 aa  204  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  33.61 
 
 
4854 aa  203  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  34.09 
 
 
3598 aa  203  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  38.85 
 
 
814 aa  195  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  39.03 
 
 
3089 aa  195  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  34.29 
 
 
2377 aa  188  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  42.11 
 
 
2503 aa  188  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  28.98 
 
 
3244 aa  186  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  38.66 
 
 
2476 aa  186  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  35 
 
 
892 aa  186  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  35.01 
 
 
1367 aa  185  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  33.61 
 
 
1867 aa  180  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.4 
 
 
850 aa  177  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.17 
 
 
994 aa  176  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30.84 
 
 
2555 aa  176  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.5 
 
 
4122 aa  167  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  40.88 
 
 
2153 aa  165  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.28 
 
 
3816 aa  162  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  25.91 
 
 
2079 aa  162  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  29.72 
 
 
1363 aa  157  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  32.71 
 
 
7284 aa  153  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.88 
 
 
8321 aa  153  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.28 
 
 
761 aa  152  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32 
 
 
2807 aa  145  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  32.17 
 
 
1779 aa  145  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.39 
 
 
2507 aa  144  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.12 
 
 
5020 aa  137  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  32.41 
 
 
1512 aa  135  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  28.69 
 
 
1706 aa  130  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.86 
 
 
2812 aa  129  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  32.79 
 
 
2715 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.9 
 
 
1599 aa  122  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.46 
 
 
4836 aa  120  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  25.36 
 
 
16311 aa  119  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  29.53 
 
 
1061 aa  114  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  33.02 
 
 
1215 aa  114  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  32.7 
 
 
1215 aa  113  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.73 
 
 
369 aa  109  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  29.84 
 
 
1428 aa  109  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  32.17 
 
 
1215 aa  108  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.21 
 
 
1215 aa  106  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.72 
 
 
1109 aa  106  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  31.21 
 
 
1215 aa  106  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  27.38 
 
 
1699 aa  105  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  35.33 
 
 
2768 aa  104  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  33.25 
 
 
4285 aa  104  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  29.61 
 
 
5094 aa  103  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.7 
 
 
3396 aa  103  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  33.11 
 
 
1416 aa  103  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  37.26 
 
 
731 aa  100  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  31.2 
 
 
6211 aa  99.8  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  26.58 
 
 
2001 aa  99.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.79 
 
 
1750 aa  98.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  35.09 
 
 
6662 aa  95.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  35.09 
 
 
6779 aa  95.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.09 
 
 
6683 aa  95.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  32.54 
 
 
1502 aa  93.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  31.59 
 
 
5769 aa  93.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  36.13 
 
 
1911 aa  93.2  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  28.26 
 
 
3182 aa  90.9  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  28.63 
 
 
3508 aa  90.5  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  25.87 
 
 
3563 aa  90.1  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  33.33 
 
 
606 aa  89  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  30.48 
 
 
1422 aa  88.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1637  VCBS  27.91 
 
 
2127 aa  88.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  34.02 
 
 
2132 aa  87.8  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.33 
 
 
5787 aa  88.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.78 
 
 
2701 aa  87  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>