More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2981 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 2296 aa  4545    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  70.18 
 
 		 2927 aa  965    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  45.97 
 
 		 3227 aa  301  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  50.81 
 
 		 1051 aa  294  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  49.84 
 
 		 439 aa  293  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  51.98 
 
 		 646 aa  291  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  32.18 
 
 		 1526 aa  286  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  52.02 
 
 		 963 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  40.27 
 
 		 1351 aa  239  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  44.55 
 
 		 1030 aa  232  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  34.66 
 
 		 2716 aa  227  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  47.66 
 
 		 1026 aa  224  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.44 
 
 		 1130 aa  220  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.87 
 
 		 1750 aa  219  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.22 
 
 		 1292 aa  205  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 		 850 aa  200  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  42.96 
 
 		 892 aa  187  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1763 aa  179  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  31.02 
 
 		 831 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  36.68 
 
 		 772 aa  176  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  38.34 
 
 		 930 aa  173  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  66.37 
 
 		 1066 aa  171  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.98 
 
 		 693 aa  163  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  39.23 
 
 		 627 aa  159  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.81 
 
 		 668 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.51 
 
 		 4855 aa  150  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  36.03 
 
 		 387 aa  150  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  39.94 
 
 		 652 aa  149  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  39.19 
 
 		 346 aa  149  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  37.41 
 
 		 676 aa  149  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  39.44 
 
 		 579 aa  149  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  35.33 
 
 		 390 aa  147  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  38.29 
 
 		 863 aa  145  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  33.99 
 
 		 709 aa  141  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  39.03 
 
 		 522 aa  141  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  38.98 
 
 		 1079 aa  135  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  35.26 
 
 		 623 aa  134  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  34.43 
 
 		 2831 aa  134  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  33.87 
 
 		 359 aa  133  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  33.85 
 
 		 588 aa  132  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.58 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  33.87 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  30.39 
 
 		 841 aa  129  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  35.2 
 
 		 391 aa  129  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  35.42 
 
 		 487 aa  129  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.26 
 
 		 5613 aa  128  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  35.31 
 
 		 930 aa  128  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  33.46 
 
 		 2961 aa  127  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  36.68 
 
 		 672 aa  125  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  33.65 
 
 		 752 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  33.02 
 
 		 425 aa  123  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1994 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.8 
 
 		 493 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  32.14 
 
 		 2271 aa  120  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  31.35 
 
 		 504 aa  120  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 719 aa  117  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  32.3 
 
 		 392 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  30.51 
 
 		 491 aa  117  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.86 
 
 		 3589 aa  116  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  28.84 
 
 		 3920 aa  116  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  32.96 
 
 		 1046 aa  116  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.38 
 
 		 2744 aa  116  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  31.55 
 
 		 510 aa  115  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 		 732 aa  114  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  34.8 
 
 		 1293 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  35.42 
 
 		 1146 aa  111  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 807 aa  111  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  34.02 
 
 		 786 aa  109  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  32.12 
 
 		 503 aa  109  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  36.29 
 
 		 498 aa  108  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  41.6 
 
 		 1371 aa  107  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  42.54 
 
 		 1275 aa  106  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  33.51 
 
 		 2421 aa  107  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  33.51 
 
 		 2807 aa  106  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  33.51 
 
 		 2454 aa  106  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  32.93 
 
 		 674 aa  106  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.51 
 
 		 2411 aa  105  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  37.91 
 
 		 1163 aa  105  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  32.13 
 
 		 2350 aa  105  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  33.51 
 
 		 2367 aa  105  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  31.89 
 
 		 2064 aa  101  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 		 770 aa  101  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33.01 
 
 		 2772 aa  99.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1030 aa  98.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  29.25 
 
 		 581 aa  98.2  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.04 
 
 		 628 aa  97.8  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  32.54 
 
 		 525 aa  97.4  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  29.88 
 
 		 448 aa  97.1  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  29.96 
 
 		 307 aa  96.7  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  38.24 
 
 		 460 aa  96.3  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  31.82 
 
 		 750 aa  96.3  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  33.19 
 
 		 472 aa  95.9  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  29.86 
 
 		 634 aa  95.5  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  28.43 
 
 		 1999 aa  94.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  32.2 
 
 		 3193 aa  94.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.33 
 
 		 4500 aa  94.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.71 
 
 		 641 aa  93.2  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  31.01 
 
 		 805 aa  92.4  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  36.72 
 
 		 799 aa  91.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1059 aa  90.5  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>