119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1618 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  100 
 
 		 2267 aa  4625    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  53.71 
 
 		 2478 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  54.79 
 
 		 2602 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  37.53 
 
 		 2487 aa  155  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  32.24 
 
 		 2588 aa  144  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  35.74 
 
 		 1461 aa  129  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  50 
 
 		 3191 aa  119  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.88 
 
 		 5745 aa  117  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  38.25 
 
 		 2377 aa  114  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  38.76 
 
 		 4896 aa  110  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.27 
 
 		 4978 aa  107  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  36.6 
 
 		 3793 aa  105  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.99 
 
 		 3471 aa  94.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.74 
 
 		 1597 aa  94  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.5 
 
 		 3927 aa  91.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  40.62 
 
 		 2064 aa  87  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  41.82 
 
 		 2005 aa  80.9  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  29.89 
 
 		 1269 aa  79.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  42.11 
 
 		 3602 aa  79  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  43.36 
 
 		 1162 aa  77.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  38.18 
 
 		 3737 aa  77  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  36.11 
 
 		 570 aa  74.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.34 
 
 		 1269 aa  73.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  29.89 
 
 		 2278 aa  72  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  36.08 
 
 		 2022 aa  72  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  31.87 
 
 		 4848 aa  70.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1139 aa  70.1  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  39.13 
 
 		 750 aa  68.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  41.18 
 
 		 1268 aa  68.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1059 aa  66.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  39.22 
 
 		 2927 aa  66.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  35.04 
 
 		 599 aa  65.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.79 
 
 		 2114 aa  65.9  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  28.08 
 
 		 1363 aa  65.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  41.67 
 
 		 627 aa  65.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  40.21 
 
 		 2421 aa  63.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  38.05 
 
 		 2772 aa  63.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.88 
 
 		 850 aa  64.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  47.62 
 
 		 721 aa  64.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  37.61 
 
 		 822 aa  63.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  42.11 
 
 		 1483 aa  63.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  40.21 
 
 		 2367 aa  62.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  40.21 
 
 		 2454 aa  62.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  40.21 
 
 		 2411 aa  62.8  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.25 
 
 		 761 aa  62.4  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  29.58 
 
 		 794 aa  62.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  32.28 
 
 		 1371 aa  62  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  40.21 
 
 		 2807 aa  61.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.25 
 
 		 994 aa  61.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  31.14 
 
 		 1386 aa  61.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  43.33 
 
 		 4748 aa  60.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.64 
 
 		 2839 aa  60.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  39.22 
 
 		 2296 aa  60.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  41.76 
 
 		 3477 aa  59.7  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  36.45 
 
 		 815 aa  59.7  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  37.14 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  37.25 
 
 		 1526 aa  59.3  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  28.6 
 
 		 3474 aa  58.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  37.25 
 
 		 8321 aa  58.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1259 aa  58.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.61 
 
 		 3227 aa  57  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  44 
 
 		 4220 aa  57  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1547 aa  56.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  40.62 
 
 		 4854 aa  56.2  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.25 
 
 		 1679 aa  56.2  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.75 
 
 		 1884 aa  56.2  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.6 
 
 		 2346 aa  55.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  37.37 
 
 		 3089 aa  55.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  37.93 
 
 		 974 aa  55.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  37 
 
 		 1066 aa  55.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  27.51 
 
 		 676 aa  54.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  39.24 
 
 		 3324 aa  53.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  29.37 
 
 		 1394 aa  53.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  33.98 
 
 		 315 aa  54.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  37.14 
 
 		 4013 aa  54.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  33.04 
 
 		 1867 aa  53.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  32.67 
 
 		 1008 aa  53.9  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  37.21 
 
 		 1911 aa  53.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  31.06 
 
 		 1389 aa  53.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  37.78 
 
 		 1706 aa  53.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  36.9 
 
 		 1022 aa  52.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 		 3816 aa  52.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  34.31 
 
 		 852 aa  52.8  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  31.3 
 
 		 2270 aa  52  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  32.11 
 
 		 871 aa  52  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  28.46 
 
 		 814 aa  52  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  44.83 
 
 		 1109 aa  52  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  30.17 
 
 		 2402 aa  51.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1303 aa  51.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  35.44 
 
 		 711 aa  51.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  41.94 
 
 		 799 aa  51.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  26.42 
 
 		 742 aa  50.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  36.08 
 
 		 792 aa  50.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  35.63 
 
 		 1141 aa  50.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  40.66 
 
 		 1287 aa  50.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26340  hypothetical protein  28.21 
 
 		 654 aa  50.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1064 aa  49.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  29.07 
 
 		 1215 aa  49.7  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000061  peptidase M11 gametolysin  26.79 
 
 		 560 aa  49.7  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.46 
 
 		 1215 aa  49.3  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>