79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1592 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1133    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  34.74 
 
 
5745 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.21 
 
 
4978 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.84 
 
 
994 aa  93.6  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.23 
 
 
850 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  33.83 
 
 
2377 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  39.04 
 
 
1269 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 
1867 aa  81.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  33.33 
 
 
1597 aa  79.7  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  39.18 
 
 
1269 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  36.95 
 
 
3477 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  41.33 
 
 
1268 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  37.69 
 
 
892 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.08 
 
 
761 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.2 
 
 
1884 aa  74.3  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  31.73 
 
 
721 aa  73.9  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.3 
 
 
2507 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  36.11 
 
 
2267 aa  70.5  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  38.79 
 
 
2602 aa  68.2  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.84 
 
 
3927 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.03 
 
 
2114 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1820  putative lipoprotein  38.39 
 
 
699 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0873981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  26.62 
 
 
1363 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.98 
 
 
4220 aa  66.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  35.77 
 
 
1750 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  29.92 
 
 
2074 aa  64.7  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  47.25 
 
 
861 aa  64.3  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.57 
 
 
1109 aa  64.3  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  39.13 
 
 
4748 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.09 
 
 
2807 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.93 
 
 
3474 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  29.13 
 
 
994 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  30.56 
 
 
4854 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  32.89 
 
 
4848 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  30.65 
 
 
2839 aa  58.9  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  24.83 
 
 
1367 aa  58.9  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  36.51 
 
 
8321 aa  58.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.45 
 
 
3363 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  34.43 
 
 
2478 aa  57.4  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  36.76 
 
 
1512 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  33.5 
 
 
2816 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  28.67 
 
 
3089 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  31.43 
 
 
1416 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.58 
 
 
3816 aa  55.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  30.88 
 
 
16322 aa  54.7  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  29.15 
 
 
1706 aa  54.7  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1931  hypothetical protein  76.67 
 
 
224 aa  54.3  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0367641  normal  0.0184449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 
1287 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3558  hypothetical protein  38.95 
 
 
269 aa  52  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1162  hypothetical protein  28.26 
 
 
640 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  30 
 
 
1911 aa  51.2  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  38.95 
 
 
4896 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35 
 
 
1283 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.68 
 
 
1066 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  35.25 
 
 
715 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  30.08 
 
 
814 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  26.92 
 
 
2767 aa  47.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  38.3 
 
 
1394 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  38.82 
 
 
628 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  37.89 
 
 
4231 aa  47.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.57 
 
 
369 aa  47.4  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5377  hypothetical protein  42.11 
 
 
580 aa  47  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0233542  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.29 
 
 
3471 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  28.67 
 
 
3191 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  42.03 
 
 
581 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  42.03 
 
 
584 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  42.03 
 
 
584 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.75 
 
 
4122 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  33.33 
 
 
797 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2687  hypothetical protein  34.78 
 
 
1518 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0579108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  24.04 
 
 
1061 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  28.77 
 
 
2153 aa  44.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  34.74 
 
 
2542 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  42 
 
 
1058 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  35.16 
 
 
974 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  27.66 
 
 
9867 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  30.72 
 
 
1502 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
2346 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  52.38 
 
 
6678 aa  43.9  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>