42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5467 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1172    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1172    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  99.31 
 
 		 581 aa  888    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  50.45 
 
 		 569 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  52.29 
 
 		 601 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  47.41 
 
 		 613 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  46.05 
 
 		 1058 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2198  hypothetical protein  36.39 
 
 		 342 aa  137  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000179032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  35.36 
 
 		 880 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  28.23 
 
 		 997 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  48 
 
 		 1867 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  27.54 
 
 		 906 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  32.23 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  30.35 
 
 		 2310 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  25.8 
 
 		 2305 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  28.01 
 
 		 909 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 885 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  38.75 
 
 		 4978 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  47.44 
 
 		 3927 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  39.18 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  42.5 
 
 		 2377 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1416 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  26.8 
 
 		 792 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  43.42 
 
 		 139 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  54.55 
 
 		 1884 aa  52  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  37.84 
 
 		 180 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1512 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  50 
 
 		 5745 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  38.67 
 
 		 1712 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  27.63 
 
 		 3378 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  40 
 
 		 157 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  40.74 
 
 		 910 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.86 
 
 		 2114 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  43.42 
 
 		 2542 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  54.55 
 
 		 4231 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  37.33 
 
 		 1141 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1246 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1949 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1592  hypothetical protein  43.94 
 
 		 570 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 		 3816 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.62 
 
 		 1063 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  40.38 
 
 		 934 aa  43.9  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>