More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1167 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  43.71 
 
 		 5745 aa  652    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 1884 aa  3670    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  43.58 
 
 		 4978 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  48.47 
 
 		 3927 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  41.02 
 
 		 2377 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.42 
 
 		 4220 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  38.31 
 
 		 3191 aa  427  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  37.94 
 
 		 1867 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  45.22 
 
 		 1597 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.81 
 
 		 4836 aa  362  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  34.42 
 
 		 2074 aa  356  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.95 
 
 		 4848 aa  350  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  35.44 
 
 		 1268 aa  350  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  35.49 
 
 		 1269 aa  344  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  34.3 
 
 		 1269 aa  343  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  35.13 
 
 		 2555 aa  294  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.01 
 
 		 2839 aa  286  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  33.43 
 
 		 2767 aa  271  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  38.22 
 
 		 892 aa  265  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  34.57 
 
 		 7284 aa  263  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  33.04 
 
 		 3474 aa  253  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  34.22 
 
 		 2816 aa  251  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  32.01 
 
 		 16322 aa  249  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.37 
 
 		 3363 aa  249  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  35.8 
 
 		 1428 aa  249  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.21 
 
 		 2114 aa  249  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  29.97 
 
 		 9867 aa  243  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.23 
 
 		 994 aa  242  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  30.87 
 
 		 1706 aa  241  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.19 
 
 		 2507 aa  230  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  32.01 
 
 		 4854 aa  224  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.14 
 
 		 2812 aa  220  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  29.9 
 
 		 2567 aa  215  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  35.38 
 
 		 5094 aa  214  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.88 
 
 		 3699 aa  214  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  33.58 
 
 		 3699 aa  210  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.98 
 
 		 4122 aa  205  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  31.71 
 
 		 5020 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  34.06 
 
 		 3477 aa  199  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.48 
 
 		 3544 aa  196  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1512 aa  193  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.86 
 
 		 3816 aa  183  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  34.05 
 
 		 721 aa  180  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  30 
 
 		 1363 aa  179  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.31 
 
 		 850 aa  178  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  31.75 
 
 		 8321 aa  176  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  28.49 
 
 		 3439 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  29.68 
 
 		 1367 aa  175  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  28.99 
 
 		 1141 aa  171  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  33.73 
 
 		 2853 aa  169  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.51 
 
 		 1433 aa  162  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  27.77 
 
 		 16311 aa  160  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  32.51 
 
 		 2353 aa  158  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.67 
 
 		 369 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.38 
 
 		 11716 aa  157  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  35.32 
 
 		 814 aa  156  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  38.19 
 
 		 1416 aa  155  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  33.15 
 
 		 2820 aa  154  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  34.74 
 
 		 2153 aa  153  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  29.94 
 
 		 1631 aa  154  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  26.37 
 
 		 2784 aa  151  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.28 
 
 		 1949 aa  148  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  25.86 
 
 		 3714 aa  148  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.56 
 
 		 761 aa  147  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  33.45 
 
 		 4798 aa  145  8e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.23 
 
 		 1279 aa  144  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  25.23 
 
 		 2656 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  28.32 
 
 		 3244 aa  142  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.83 
 
 		 5787 aa  142  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.79 
 
 		 5839 aa  139  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  26.37 
 
 		 3758 aa  138  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.09 
 
 		 2807 aa  137  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.94 
 
 		 1599 aa  136  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  25.45 
 
 		 3182 aa  137  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  26.03 
 
 		 3229 aa  132  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.47 
 
 		 1109 aa  131  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  28.8 
 
 		 4285 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.04 
 
 		 1795 aa  130  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  36.14 
 
 		 4791 aa  130  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1061 aa  129  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.5 
 
 		 1779 aa  128  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.67 
 
 		 946 aa  127  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.78 
 
 		 1363 aa  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  36.81 
 
 		 5442 aa  125  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.32 
 
 		 4334 aa  125  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  29.62 
 
 		 1532 aa  123  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  27.84 
 
 		 4661 aa  123  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.25 
 
 		 1963 aa  122  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.68 
 
 		 1063 aa  122  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 1408 aa  119  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.72 
 
 		 2678 aa  119  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 1410 aa  119  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 1410 aa  119  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1056 aa  119  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.42 
 
 		 1534 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  30.25 
 
 		 2954 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  34.86 
 
 		 2105 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  32.5 
 
 		 2503 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.98 
 
 		 2768 aa  116  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30 
 
 		 1499 aa  115  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>