74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4736 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
1433 aa  2821    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2591  hypothetical protein  32.05 
 
 
1188 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225113  normal  0.278205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3803  hypothetical protein  31.21 
 
 
1181 aa  296  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  30.29 
 
 
3927 aa  185  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.54 
 
 
1884 aa  177  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.82 
 
 
2377 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.83 
 
 
1056 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.46 
 
 
1949 aa  113  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  26.62 
 
 
1867 aa  105  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.78 
 
 
1067 aa  103  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.08 
 
 
1063 aa  99.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  28.39 
 
 
1597 aa  95.5  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  31.46 
 
 
567 aa  89  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.67 
 
 
802 aa  89  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.82 
 
 
5745 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  31.48 
 
 
666 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  25.97 
 
 
4978 aa  85.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  30.67 
 
 
898 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.89 
 
 
2507 aa  80.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.79 
 
 
777 aa  79.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  26.79 
 
 
1512 aa  73.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  25.09 
 
 
2784 aa  72.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.37 
 
 
369 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.31 
 
 
2114 aa  66.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  29.62 
 
 
1416 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.15 
 
 
2816 aa  63.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  30.46 
 
 
906 aa  63.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  33.86 
 
 
1039 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  26.79 
 
 
1269 aa  60.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  27.06 
 
 
3439 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.87 
 
 
4798 aa  59.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  30 
 
 
663 aa  59.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  24.85 
 
 
2074 aa  57.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  28.84 
 
 
1215 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  32.64 
 
 
892 aa  57  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  29.07 
 
 
1215 aa  56.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.52 
 
 
2812 aa  55.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.91 
 
 
850 aa  55.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  25.31 
 
 
1269 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  25.97 
 
 
2555 aa  54.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  35.34 
 
 
909 aa  53.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  30.27 
 
 
2567 aa  52.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  31.17 
 
 
1712 aa  52.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  24.43 
 
 
5020 aa  50.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  27.14 
 
 
8321 aa  50.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  23.55 
 
 
3714 aa  51.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  26.8 
 
 
1268 aa  50.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  30.6 
 
 
1058 aa  48.9  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.06 
 
 
2839 aa  49.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4700  hypothetical protein  36.09 
 
 
2698 aa  49.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709916  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  24.44 
 
 
1706 aa  48.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.68 
 
 
994 aa  48.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  24.41 
 
 
2524 aa  48.5  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  27.5 
 
 
1779 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  30 
 
 
613 aa  47.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.88 
 
 
6683 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  35.9 
 
 
2542 aa  47.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  27.43 
 
 
3091 aa  47.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  27.88 
 
 
6779 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  34.48 
 
 
815 aa  47.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 
6662 aa  47  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  28.66 
 
 
1215 aa  46.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.66 
 
 
1215 aa  46.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.52 
 
 
761 aa  46.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  39.34 
 
 
139 aa  45.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  30.72 
 
 
1350 aa  45.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  30.72 
 
 
1806 aa  45.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  26.45 
 
 
3477 aa  45.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  28.39 
 
 
1141 aa  45.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  33.53 
 
 
3378 aa  45.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  25.16 
 
 
4848 aa  45.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  27.76 
 
 
1215 aa  45.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  28.49 
 
 
4285 aa  45.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  32.99 
 
 
581 aa  45.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>