69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0847 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  100 
 
 
567 aa  1107    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.35 
 
 
777 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  48.24 
 
 
666 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.64 
 
 
1063 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.81 
 
 
1067 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40 
 
 
1949 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.78 
 
 
1056 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.88 
 
 
802 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  42.98 
 
 
1039 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  35.97 
 
 
1867 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  34.53 
 
 
2377 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.45 
 
 
3927 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 
1433 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.94 
 
 
1884 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  35.91 
 
 
898 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  30.89 
 
 
8321 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  25.32 
 
 
1597 aa  69.3  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.91 
 
 
2507 aa  68.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.35 
 
 
1215 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  32.17 
 
 
5745 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  28 
 
 
1215 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  28 
 
 
1215 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.89 
 
 
369 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2591  hypothetical protein  32.13 
 
 
1188 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225113  normal  0.278205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  26.17 
 
 
1215 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  26.17 
 
 
1215 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.58 
 
 
1066 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.84 
 
 
4978 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  39.45 
 
 
4231 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  28.72 
 
 
1512 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32 
 
 
1712 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.78 
 
 
4798 aa  52.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  37.5 
 
 
2542 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.49 
 
 
1109 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  26.88 
 
 
2784 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.34 
 
 
2816 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  42.11 
 
 
139 aa  50.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  29.61 
 
 
715 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  33.33 
 
 
2461 aa  50.8  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  27.73 
 
 
3439 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  32.75 
 
 
2555 aa  50.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  23.08 
 
 
5020 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  28.48 
 
 
663 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  31.4 
 
 
721 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.71 
 
 
994 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3803  hypothetical protein  36.52 
 
 
1181 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2224  hypothetical protein  45.36 
 
 
998 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  26.92 
 
 
1416 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.84 
 
 
1599 aa  47.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  28.23 
 
 
2887 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.84 
 
 
850 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  32.26 
 
 
1141 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  28.98 
 
 
1806 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  25.3 
 
 
1706 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  28.98 
 
 
1350 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  36.62 
 
 
1006 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  27 
 
 
892 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  28.45 
 
 
1631 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  27.67 
 
 
3229 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.47 
 
 
3816 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  46.67 
 
 
613 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.41 
 
 
1779 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.38 
 
 
3363 aa  44.3  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  28.48 
 
 
909 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  36.84 
 
 
157 aa  43.9  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.46 
 
 
6678 aa  43.9  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  26.84 
 
 
3182 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.91 
 
 
2678 aa  43.5  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1504  hypothetical protein  45 
 
 
675 aa  43.5  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>