14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1504 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  61.97 
 
 
693 aa  754    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1504  hypothetical protein  100 
 
 
675 aa  1332    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3535  hypothetical protein  40.93 
 
 
324 aa  170  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00326284  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1499  hypothetical protein  35.09 
 
 
309 aa  148  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3533  hypothetical protein  38.6 
 
 
303 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5247  hypothetical protein  35.57 
 
 
318 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0060  hypothetical protein  28.14 
 
 
762 aa  78.2  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  27.73 
 
 
581 aa  77.8  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4888  hypothetical protein  29.41 
 
 
423 aa  58.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1752  hypothetical protein  28.81 
 
 
465 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  25.08 
 
 
402 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  27.74 
 
 
389 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0432  hypothetical protein  27.05 
 
 
362 aa  45.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3763  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  23.56 
 
 
387 aa  43.9  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>