13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0432 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0432  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  756    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5247  hypothetical protein  32.21 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1499  hypothetical protein  25.25 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  31.72 
 
 
581 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3533  hypothetical protein  27.13 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3535  hypothetical protein  26.44 
 
 
324 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00326284  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1752  hypothetical protein  23.96 
 
 
465 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0060  hypothetical protein  25.34 
 
 
762 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4888  hypothetical protein  25.75 
 
 
423 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  24.58 
 
 
693 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3188  hypothetical protein  29.41 
 
 
315 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.411764  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  27.49 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1504  hypothetical protein  27.05 
 
 
675 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>