18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5243 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  100 
 
 
693 aa  1370    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1504  hypothetical protein  61.97 
 
 
675 aa  723    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3535  hypothetical protein  41.28 
 
 
324 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00326284  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3533  hypothetical protein  40.15 
 
 
303 aa  147  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5247  hypothetical protein  36.76 
 
 
318 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1499  hypothetical protein  36.22 
 
 
309 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0060  hypothetical protein  31.94 
 
 
762 aa  95.1  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  28.26 
 
 
581 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1752  hypothetical protein  29.59 
 
 
465 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4888  hypothetical protein  30.73 
 
 
423 aa  58.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  25.37 
 
 
402 aa  57.4  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0432  hypothetical protein  24.67 
 
 
362 aa  55.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0718  hypothetical protein  27.95 
 
 
387 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  36.02 
 
 
746 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  28.14 
 
 
389 aa  50.8  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.49 
 
 
1056 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  41.43 
 
 
3378 aa  45.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3188  hypothetical protein  27.43 
 
 
315 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.411764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>