15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0060 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 762 aa  1540    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  32.7 
 
 		 581 aa  125  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1499  hypothetical protein  32.32 
 
 		 309 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5247  hypothetical protein  34.13 
 
 		 318 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  26.54 
 
 		 402 aa  88.2  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3535  hypothetical protein  33.68 
 
 		 324 aa  87.8  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00326284  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  32.56 
 
 		 693 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0718  hypothetical protein  26.76 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1752  hypothetical protein  31.61 
 
 		 465 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  26.97 
 
 		 389 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1504  hypothetical protein  28.29 
 
 		 675 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3188  hypothetical protein  32.78 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.411764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0432  hypothetical protein  25.34 
 
 		 362 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4888  hypothetical protein  26.23 
 
 		 423 aa  48.5  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>