14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3533 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3533  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  597  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3535  hypothetical protein  71.58 
 
 
324 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00326284  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1499  hypothetical protein  53.9 
 
 
309 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5247  hypothetical protein  52.58 
 
 
318 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  38.81 
 
 
693 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1504  hypothetical protein  38.6 
 
 
675 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0060  hypothetical protein  33.7 
 
 
762 aa  92.8  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  31.12 
 
 
581 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0432  hypothetical protein  26.72 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0718  hypothetical protein  32.16 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  25.57 
 
 
402 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1752  hypothetical protein  24.1 
 
 
465 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4888  hypothetical protein  28.78 
 
 
423 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3188  hypothetical protein  27.23 
 
 
315 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.411764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>