13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0718 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0718  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  778    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0060  hypothetical protein  26.76 
 
 
762 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5247  hypothetical protein  28.47 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  27.39 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1499  hypothetical protein  28.04 
 
 
309 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  25.58 
 
 
581 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3533  hypothetical protein  29.65 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  25.7 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3535  hypothetical protein  26.69 
 
 
324 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00326284  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3188  hypothetical protein  28.01 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.411764  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  25 
 
 
802 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1504  hypothetical protein  28.95 
 
 
675 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  28.51 
 
 
693 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>