55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2277 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  786    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1752  hypothetical protein  57.77 
 
 
465 aa  342  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3188  hypothetical protein  56.27 
 
 
315 aa  315  6e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.411764  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  50.72 
 
 
402 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.34 
 
 
802 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  63.01 
 
 
848 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  35.59 
 
 
787 aa  103  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  58.57 
 
 
958 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  58.33 
 
 
668 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  58.57 
 
 
749 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  52.7 
 
 
403 aa  96.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  56.16 
 
 
433 aa  96.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  47.06 
 
 
488 aa  96.3  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  61.76 
 
 
735 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  54.79 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  56.94 
 
 
919 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  56.34 
 
 
627 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  55.41 
 
 
294 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  58.57 
 
 
930 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  60.56 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  61.9 
 
 
561 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  56.58 
 
 
468 aa  93.6  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  56.34 
 
 
298 aa  93.2  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  54.17 
 
 
739 aa  93.2  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  53.33 
 
 
581 aa  92.8  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  37.41 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  36.21 
 
 
479 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  50 
 
 
579 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  46.67 
 
 
869 aa  89.4  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  52.44 
 
 
697 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  45.74 
 
 
676 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  50 
 
 
698 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  43.14 
 
 
479 aa  86.3  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.72 
 
 
547 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  50.7 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  51.43 
 
 
1056 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  53.97 
 
 
522 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  50 
 
 
522 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  46.58 
 
 
110 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  50 
 
 
831 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0060  hypothetical protein  27.61 
 
 
762 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  50 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  46.48 
 
 
709 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  44.26 
 
 
472 aa  66.2  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  46.15 
 
 
887 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  39.74 
 
 
595 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  42.62 
 
 
528 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.52 
 
 
594 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  41.43 
 
 
884 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  38.67 
 
 
883 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  39.73 
 
 
975 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  24.46 
 
 
581 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5247  hypothetical protein  27.92 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0718  hypothetical protein  26.03 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  35.06 
 
 
1531 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>