15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5247 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5247  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  638    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1499  hypothetical protein  75.41 
 
 
309 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3533  hypothetical protein  51.71 
 
 
303 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3535  hypothetical protein  49.65 
 
 
324 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00326284  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1504  hypothetical protein  35.18 
 
 
675 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  36.36 
 
 
693 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0060  hypothetical protein  34.13 
 
 
762 aa  96.3  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  30.74 
 
 
581 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0432  hypothetical protein  32.21 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0718  hypothetical protein  28.25 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1752  hypothetical protein  27.68 
 
 
465 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  27.66 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3188  hypothetical protein  26.79 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.411764  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4888  hypothetical protein  26.81 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  27.92 
 
 
389 aa  49.3  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>